日月魔教纵横四海，势力日盛，欲一统江湖。五岳剑派组成正义联盟与魔教抗衡。任我行闭关练功，东方不败为了日月神教教主之位谋划五岳剑派进攻日月神剑，还派人将任盈盈抓走。任我行的妻子以为是五岳剑派抓了盈盈，便前去寻找，东方不败为了自己的计划，杀死了任夫人。

东方不败执掌黑木崖，练起葵花宝典。令狐冲、陆猴儿以及小师妹一起下山采集物品，两人支开小师妹跑去喝酒，遇到青城派的人调戏伪装成青楼女子的东方不败。令狐冲不明情况，仗义出手，与其二人缠斗起来。

林震南问林平之尸首是怎么处理的，林震南带领下人去挖开了坟看到果然是青城派的人。

令狐冲和东方不败一起偷酒喝，东方不败现在没有了教主的身份，所以自己现在和令狐冲在一起很是开心。他们在田野里过夜，令狐冲喝酒欣赏着东方不败舞剑，令狐冲说眼前的这个好像是以前就下来的姑娘。但是东方不败说自己就是男子，令狐冲说了自己眼里只有小师妹，在一生中只会对她一个人好。

木高峰假意收林平之为徒，却要林平之给他磕三个头叫三声爷爷才肯答应。东方不败以内力续令狐冲生命，就是用自己的生命续他生命。东方不败以内力保护了令狐冲的生命，坐在一旁守护着令狐冲。

定逸师太要岳不群交出令狐冲。即便岳不群不相信，但所有罪证全部指向了令狐冲。幸好仪琳及时赶到，还带来了令狐冲死了的消息。东方不败趁机带走了仪琳，与令狐冲躲进了妓院。田伯光仗义出手引开了定逸师太等人。林平之摆脱木高峰，拜岳不群为师。

仪琳陪令狐冲在破庙里养伤。刘正风决定金盆洗手，退出江湖。然而，嵩山派却在拿着左冷禅的令旗要求刘正风不要金盆洗手，并且在限定的期限内杀死魔教右使曲洋。刘正风不从，嵩山弟子杀死了他的妻儿。危急时刻，曲洋赶到，救走了刘正风。费彬追到河边，不听刘正风解释，执意要杀死两人，不料被刘正风师兄所杀。

刘正风和曲洋深受重伤，遂将《笑傲江湖》传予令狐冲，两人心愿已了在大笑中了却一生。令狐冲和仪琳给两埋入黑土，并拜别，仪琳不经意掉落了一件物品。东方不败也来到墓地拜别曲洋，和属下要返回黑木崖行走间踩到仪琳掉落的东西，捡起陷入沉思。令狐冲和仪琳发现木高峰对林震南夫妇。林震南见夫人被杀自断筋脉。派众人回到华山派，宁中则觉得林平之文弱，林平之暗下决心，一定要加倍努力。仪琳在回到恒山后却每日想着令狐冲。东方不败回到黑木崖偶尔也会想起和令狐冲在一起喝酒的日子。岳灵珊缠着宁中则要她教自己玉女岳不群不知想到了什么同意了岳灵珊的请求。

岳灵珊高兴地跑到思过崖告诉了令狐冲自己能够学习玉女剑法的消息。林平之武功不济，陪岳灵珊练剑被嫌弃。岳灵珊因为自己言语间误伤林平之，愧疚之下悉心教导林平之功夫。岳灵珊跟着林平之下山玩耍，还被林平之吻了。两人爱意渐浓。而此时，令狐冲依然被困思过崖。

陆猴儿指责岳灵珊喜欢上林平之，背叛令狐冲。岳灵珊心烦意乱之下冒雪给令狐冲送饭，还刻意躲着林平之。林平之趁着岳灵珊生病之际几次三番轻薄她，深情表白动摇了岳灵珊的心。左冷禅以祝寿为名将五岳剑派的人召集到嵩山，欲统一五岳剑派。

令狐冲打掉了岳灵珊的剑，事后十分内疚。风清扬继续在思过崖上教授令狐冲功夫。林平之用苦肉计终于赢得了岳灵珊的芳心。华山派的其他弟子看不惯林平之横刀夺爱，故意为难林平之。岳灵珊为林平之抱不平，冤枉令狐冲。令狐冲在思过崖上偶然发现了刻有五岳剑派武功秘籍的石洞，练功之后差点走火入魔。东方不败找到了护身护，确定仪琳就是自己的妹妹。

东方不败找到了护身符，确定仪琳就是自己的妹妹，利用王妃抓住了好色的田伯光，让田伯光将令狐冲送到仪琳面前。令狐冲在比剑时差点误伤他师母，并惹怒岳不群。岳不群趁机讲述了华山派剑宗和气宗的争斗。田伯光上思过崖用各种手段想将令狐冲带下山。

东方不败一听思过崖，想着以前和令狐冲喝酒提到有一天令狐冲被罚会带着美酒和肥鸡去看他，决定亲自去一趟。风清扬站在思过崖洞外，见到东方不败用轻功飞上思过崖，两人没说两句便比试起武功谁也奈何不了谁，东方不败告诉风清扬自己是来送饭的，在洞外大喊令狐冲的名字。令狐冲出来相见，风清扬见认识便不再管他们但也提醒令狐冲他的武功很高。

封不平，成不忧，上入华山，并打伤弟子叫岳不群出来。岳不群已不认他们为华山弟子，两人前来就是要夺回华山掌门的位子。成不忧更是出手和宁中则打了起来，宁中则不是对手，岳不群出手用紫霞神功打败成不忧，正当对峙之时左冷禅弟子丁勉来到发布盟主令要岳不群退位让给封不平。陆猴儿急忙跑到思过崖把出事的消息告诉令狐冲，令狐冲一听华山有难赶紧下崖，东方不败却也紧跟而来。

岳不群命人假扮令狐冲暗算东方不败，东方不败临危不乱脱险。岳不群要去嵩山找左冷禅理论，却不能带令狐冲前去。宁中则想让岳不群把紫霞秘笈留给令狐冲自行练习，岳不群没有同意。岳灵珊偷取了紫霞秘笈交给了陆猴儿，但陆猴儿却惨遭不测，紫霞秘籍也不见了。一群黑人蒙面人以为辟邪剑谱在岳不群手中，双方拼杀起来。宁中则不敌被蒙面人抓住威胁岳不群，岳不群也束手被擒。众人被擒，这时嵩山派的陆柏和封不平出现了。

正当封不平要出手杀死众人之时，令狐冲已然起来和封不平打了起来，令狐冲剑法高超，击败封不平。陆柏自觉不敌令狐冲也告辞。但黑衣蒙面人却没有离开，令狐冲内力全无却还是一招内刺瞎所有人眼睛。岳不群对令狐冲产生了怀疑。东方不败耍弄田伯光，田伯光被打得满脸是包。半夜令狐冲梦到陆猴儿，被恶梦惊醒，令狐冲起床却听到门外德诺和师弟在说话，原来岳不群不相信令狐冲派德诺监视他。岳不群一行来到洛阳，林平之外公前来拜访。林平之的舅舅向令狐冲要辟邪剑谱，任凭令狐冲如何解释，林平之舅舅都不相信，直接对令狐冲出手拿到了令狐冲怀中的笑傲江湖曲认为这便是辟邪剑谱。

令狐冲将《笑傲江湖》的曲谱交给了王家以证明清白，但是大家都看不懂，只能找绿竹翁演绎曲谱。绿竹翁和他的姑姑成功演奏出乐曲，确定这本曲谱不是武功秘籍。但是，王家人依然怀疑令狐冲拿走了辟邪剑谱。令狐冲将曲谱送给了绿竹翁的姑姑，并被请入屋内学琴，但又不得不离开。

蓝凤凰为了变美不惜一切偷盗岳不群的希夷剑，让平一指为她整容。岳不群追到平一指住处，被平一指不敬的的态度气走。平一指专程到客栈为令狐冲治病，还将希夷剑还给了岳不群。令狐冲在酒楼里与祖千秋喝酒、论酒，十分投缘，喝下了黄河老祖的续命八丸。夜里，岳灵珊和林平之都怀疑是令狐冲拿走了辟邪剑谱，结果被突然出现的人教训。令狐冲从岳不群房里出来后，被人黄河老祖掳走。

黄河老祖掳走令狐冲，盘问他与祖千秋的关系，讲述了自己炼制续命八丸的经过，还要用令狐冲的血救他的女儿。祖千秋及时赶到，阻止了黄河老祖。但是知道事情原委的令狐冲甘愿用自己的血为黄河老祖的女儿治病。计无施拦下追来的岳不群和蓝凤凰，将令狐冲送回了客栈，并请他第二日到五霸岗相聚。令狐冲被众人用轿子接到了五霸岗，和大家喝酒喝的十分尽兴。任盈盈下令让天下江湖人追杀令狐冲。

东方不败为治令狐冲伤势，孤身前往雪狼谷取胆，被令狐冲所救后，向其表露心声，两人渐生情愫。岳不群看到两人在一起大怒，要求令狐冲杀了东方不败，令狐冲不依。东方不败为救令狐冲，答应了灵鹫寺方丈在寺内禁闭，而令狐冲却不知情，拒绝修炼易筋经，独自一人下山离去。

东方不败背着令狐冲上灵鹫寺求医，却不料令狐冲自己下山。下山后的令狐冲在半路偶遇遭难的任盈盈并出手相救。经过一番了解，二人互生好感，任盈盈决定陪他一同去疗伤。

令狐冲和四位庄主比剑。首先是丹青生，用剑，只是十几招令狐冲便赢得了丹青生。再一个上场的是秃笔翁，用笔，自然也不行了。三人中最后一个上场的是黑白子，用的是磁铁所作的棋盘，也是输得一蹋糊涂。三人都输自己然是拿不到任盈盈的东西了。在令狐冲赢了大庄主之后，四人带他去见任我行。

令狐冲进去后偷偷把任盈盈托付的东西交给了任我行，任我行神色不变，两人便比试来，任我行震晕四人后，留下令狐冲假扮自己便逃脱了。这黑白子带着美酒肥鸡来到囚室要任我行（令狐冲）传他武功。于是令狐冲便胡编了四句传给黑白子。令狐冲使出了吸星大法对付黑白子并拿了囚室的钥匙逃了出来。任盈盈和任我行告诉了令狐冲事情的经过，并向令狐冲赔罪。任我行见令狐冲人品不错武功也好，便要将任盈盈许配给令狐冲，并让令狐冲当他的副教主。令狐冲一直以为和任盈盈只是萍水相逢便拒绝了任我行的好意，并告诉任我行已心有所属。

任盈盈说出绿竹巷和五霸岗的婆婆就是她。令狐冲这才完全明白任盈盈为他所做的一切。令狐冲假扮军爷寻找华山众人。定静被一群蒙面人围攻被砍断了胳膊被令狐冲出手救下。恒山弟子火化了定静后便在令狐冲的带领下来到了无厢庵。令狐冲一路行来在街上见到了师傅及华山众人，看着众人却不敢相认。令狐冲为帮令平直夺回袈裟中了毒镖。令狐冲苦苦哀求岳不群想要重回华山，岳不群并未答应还狠狠责骂他和魔教圣姑来往。

令狐冲哀求岳不群想要重回华山，这时嵩山派的陆柏带人来了。岳不群告诉陆柏令狐冲已不是华山之人。陆柏没了顾及便出手对付令狐冲。情况紧急之下令狐冲使出了吸星大法。劳德诺跑后林平之管令狐冲要林家的袈裟，令狐冲告诉林平之岳不群替他疗过伤袈裟就在房间里。岳灵珊追上令狐冲直接对令狐冲出手，令狐冲很生气岳灵珊也认为他是这样的人。岳不群，宁中则，岳灵珊和林平之四人在返回华山的途中准备在一处废屋过夜，林平之明白只有岳灵珊才能救得了他。为了讨得岳灵珊的欢心林平之不惜爬上很危险的山峰为岳灵珊摘花。现在的林平之和岳灵珊可以说是寸步不离。半夜令狐冲听到白蛟帮弟子要谋害恒山之人便出手抓了两人。

莫大告诉令狐冲魔教圣姑对他一往情深要令狐冲不要辜负了人家。回到华山的岳不群犹豫是否要自宫修炼辟邪剑谱，宁中则的话更加坚定了岳不群的想法。夜晚林平之一人对着树木乱砍，直到岳灵珊走了林平之才清醒过来他的命还得靠着岳灵珊。方证大师和定逸师太一起来到东方不败之处，告诉东方不败可以走了。东方不败留在灵鹫寺不但功力恢复了不少心态也平和了许多。夜晚岳不群假装约定逸去佛堂说有事向她解释。定逸刚问什么计策，岳不群突然出手杀死了定逸。

恒山派的定逸师太遭到暗算，临死前将衡山派掌门之位交给令狐冲。众人希望寻找到圣姑的下落，却被人困在灵鹫寺中，令狐冲与铜人大战，获胜之后找到了任盈盈和任我行。

东方不败逼问令狐冲的下落，岳不群骗东方不败令狐死了。东方不败听到令狐冲死了当即就陷入了疯狂。东方不败杀光了余沧海的弟子，呆坐在地上，看到令狐冲过来紧紧的抱着他，令狐冲神色冰冷的对待东方不败。令狐冲一剑刺向东方不败，东方不败从此与令狐冲恩断义绝。东方不败下令召集所有魔教弟子杀尽天下负心汉。任我行经过令狐冲的帮助体内寒气尽去，再次劝令狐冲加入日月神教，令狐冲又一次拒绝了。左冷禅想要在中秋一统五岳剑派。岳不群决定在闭关期间自宫。

出关后的岳不群武功大进，却女人女气。林平之求岳不群把岳灵珊嫁给他，岳不群同意了。东方不败让田伯光上恒山追随仪琳一生一世保护她，否则便杀了他。任我行一直想要夺回教主之位，但现在黑木崖防守太严密，任盈盈决定自己先上黑木崖探探情况。任盈盈回到黑木崖，东方不败要求任盈盈不准再喜欢令狐冲也不准见他。接任大典刚刚开始，嵩山的陆柏就来了，用盟主令阻止令狐冲接任掌门。任盈盈与蓝凤凰当场羞辱了陆柏。

灵鹫山的和尚们与令狐冲商议在嵩山大会上对抗左冷禅，极力规劝令狐冲夺取五岳剑派的掌门，并讲述了葵花宝典的来历。日月神教贾布等人打算强行将令狐冲等人带走，幸好任盈盈及时感到解围。仪琳向哑婆婆讲自己的心里话。任我行等人乔妆打扮上黑木崖，终于见到了东方不败。

东方不败坐在屏风后绣着自己和令狐冲曾经的快乐日子，令杨莲花醋意横生。令狐冲与任盈盈逃出了陷阱，闯入东方不败住处。东方不败刺瞎了任我行的一只眼，掉下山崖。任我行重掌日月神教，毁掉了葵花宝典。令狐冲拒绝加入日月神教，惹恼任我行。田伯光想让仪琳还俗，嫁给令狐冲。

岳不群偷练辟邪剑谱性情大变，被他妻子发现真相，两人发生了激烈的争吵。林平之偷听得知林家的辟邪剑谱被岳不群偷走，气愤之余斥责岳灵珊，并自宫练剑法。大婚之夜，林平之不能人道，污蔑岳灵珊与令狐冲有染。令狐冲得知岳灵珊大婚，借酒消愁。任盈盈被三尸脑神丹折磨，无药可救，令任我行十分担心。

五岳剑派齐聚嵩山，商量五岳剑派合而为一的事。左冷禅一心想要合并五岳剑派，泰山、衡山、都受到威胁，不得已同意合并。蓝凤凰大闹五岳剑派合并大会，惹得左冷禅对她动了杀心。

玉玑子出来找蓝凤凰麻烦，没想到了中了蓝凤凰的毒。蓝凤凰在大殿内拥护令狐冲，并说要比剑夺帅。左冷禅约定明日比武。岳不群向令狐冲说出了自己的苦衷，令狐冲决意竭尽全力。第二日，令狐冲故意让岳灵珊刺伤自己，并且自己震伤了自己。而左冷禅和岳不群交手后众人都看不出两人所使剑法，左冷禅被岳不群刺瞎了双眼。岳不群当上了五岳派的掌门。

林平之一路找余沧海报仇，发誓要让青城派从此消失。林平之杀了余沧海，但是双眼却中毒失明。岳灵珊跟着照顾林平之，林平之告诉岳灵珊他和岳不群都练了辟邪剑谱。

林平之为了给左掌门表忠心，一剑刺向了岳林姗。令狐冲抱着重伤的岳灵珊回去养伤了，可是没想到在疗伤过程中岳灵珊却想着去自尽。为了帮任盈盈解三尸脑神丹的毒，教主想尽了各种办法。

岳林姗千里迢迢来到嵩山，只为找林平之，只可惜林平之却不领情。岳不群为了笼络人心，竟叫人参观秘洞。岳不群想借任盈盈引令狐冲出来，并杀之。

田伯光见仪琳又不开心便说自己走了，仪琳没留他。仪琳对哑婆婆说起自己真的很想念令狐冲大哥，令狐冲很想安慰一下这个善良的女孩子却又怕仪琳认出自己。仪琳刚走令狐冲背后现一个和自己穿着一样衣服的人，令狐冲以为是真的哑婆婆来了，来人直接点了他的穴道拖到一间房内，蒙上了令狐冲的眼睛。蒙面人抓住任盈盈带到了恒山和令狐冲一起。东方不败让令狐冲娶两个，要是不答应就阉了他。这时老白，黑熊等魔教四人把恒山的水中都下了药。岳不群拿着黑木令让魔教弟子把恒山弟子和其他人送到华山。任盈盈立刻命令上报教主。令狐冲用独孤九剑杀了左冷禅等人，并废了林平之的武功。

令狐冲和任盈盈被岳不群抓了起来，仪琳赶到了背后一剑杀了岳不群。令狐冲让众人放了华山弟子并指明了梁师弟接任掌门之位。第二天，任我行要众人到朝阳峰相叙。令狐冲觉得现在任我行比东方不败在时的规矩更加变本加励。任我行要令狐冲解散恒山派或者加入日月神教做副教主。令狐冲自然不会答应，但求任我行把任盈盈许配给他的事任我行同意了。任我行一个月后要亲自杀上恒山。令狐冲带着恒山弟子先走了。深夜任盈盈的三尸脑神丹剧毒便发作了出现了幻觉，任我行很紧张的守着她。

东方不败扮成哑婆婆来到恒山，被仪琳发现，姐妹俩终于相见。方证、方生大师来到恒山帮助令狐冲对抗日月神教，并且方证大师将易筋经口诀教给令狐冲。为了救盈盈，令狐冲独闯黑木崖，与任我行大打出手。

任我行要一掌打死令狐冲，危急时刻东方不败出手杀死了任我行。而东方不败为了解任盈盈身上的毒，挖出了自己的心给了任盈盈。任盈盈安排好教中事务之后，就将日月神教教主之位传给了向问天，然后便与令狐冲一起过起远离江湖纷争的日子。