时间过得真的好快，木叶丸他们终于成为了可以执行任务的小组了，虽然冒冒失失，莽莽撞撞，但是总算把任务完成了，不过木叶丸和当年的鸣人真的好像啊，一上场就要求执行更复杂的任务。不过，这么长时间了，鸣人和自来也的修行终于结束了，两人回到了村子里，鸣人一阵感慨，村子还是一点都没变呢，只是多了一个纲手的影岩。多年没见，鸣人变得更高更强壮了，只是个别神经还是......

为了测试鸣人的修行成果，火影特地安排了一个人来和鸣人对决。就在众人好奇那个参与对决的人是谁的时候，火影办公室的门被敲开了，鹿丸和手鞠出现在大家的眼中。可是和他对决的并不是他们俩，居然是卡卡西！鸣人看到卡卡西那叫一个激动啊，居然把亲热系列的未出版本送给卡卡西当礼物，这个礼物超级讨卡卡西喜欢的。不过，试炼是必须进行的，收起了亲热天堂，卡卡西即将成为小樱和鸣人的对手。

这回的试炼还是从卡卡西身上抢夺铃铛，与当年不同的是，这回卡卡西没有一边看书一边战斗，不仅如此，他还使用了写轮眼，就在卡卡西感叹鸣人成长的同时，鸣人也趁机绕到卡卡西的背后。但是这一切只是开始，卡卡西顺利脱身后，他们的战斗会变成怎样呢？另一方面，砂隐遭到了晓的攻击，整个村子外围的士兵都被晓的两个成员杀光了。砂隐将陷入空前的危机中。

自来也、纲手和卡卡西在看到鸣人和小樱的成长后，不禁感到欣慰，然而在砂隐，一切则没有那么平静了，晓组织的潜入，让整个忍者村陷入了危机，身为风影的我爱罗同一名晓组织成员搏斗着。可是这名晓组织的成员是特别善于爆破的迪达拉，他可以不停的制造炸弹，我爱罗一时半会也没什么更好的办法，两个人的战斗会有怎样的结果呢？晓组织会被我爱罗赶出村子吗？

我爱罗好歹是一尾的人柱力，怎么会轻易被打败，但是迪达拉似乎很渴望能被我爱罗抓住，这明显就是迪达拉的阴谋，村子中的忍者们想的还是太少了。迪达拉果然从我爱罗制造的牢笼中逃了出来，可是我爱罗利用砂的力量再次将迪达拉拽了回去，两人的战斗陷入胶着状态，看着都让人揪心。不过在木叶那边，鸣人和小樱顺利的摘到了卡卡西身上的铃铛，根据火影的分配，他们三人将成为卡卡西组，以后没有师生之分，而是一个组里面互助的伙伴，一同执行任务。

木叶村一片祥和，一乐拉面依旧那么吸引人，肚子饿扁了的时候果然是要吃一乐拉面，就在老板要请鸣人吃拉面的时候，伊鲁卡老师出现了。与此同时，砂隐陷入了战争中，迪达拉的炸弹在村子中引爆，我爱罗用自己的沙子为整个村庄建立了一个屏障，保护村子不受伤害，可是他消耗了大量的查克拉，并且忽略和迪达拉保持距离，结果，我爱罗中了迪达拉的一记爆炸。不知不觉迪达拉在沙子中注入了炸弹，于是我爱罗在自己的绝对防御中被炸弹炸到了。

勘九郎挂念着被地达罗带走的我爱罗，便立刻展开追踪，虽然一路上蝎刻意隐瞒了行踪，但勘九郎靠着我爱罗掉落在路上的砂子，总算追上蝎与地达罗的脚步……

纲手在接获砂忍者村的紧急信函之后，决定派出新成立的卡卡西小组前去支援。此时，勘九郎为了救回我爱罗而与蝎对战，没想到却因此让自己陷入了极危险的困境之中……

卡卡西小组在接下任务后，便立刻出发前往砂忍者村。鸣人得知我爱罗遭晓掳走之后，心急地一心只想赶去救出我爱罗，因为他对我爱罗所受的痛苦感同身受……

地达罗与蝎带回我爱罗之后，晓的成员便立刻开始对他施术。而卡卡西小组则是继续赶往砂忍者村，纲手也另外指派刚结束任务的阿凯小组前去支援卡卡西小组……

就在砂的医疗忍者们为勘九郎身上的毒束手无策之际，小樱他们终于及时赶到。得到了纲手真传的小樱，发挥了惊人的治病与解毒能力，使得勘九郎所中的毒也因此得到了排解……

卡卡西在帕克追查出晓的据点之后，便决定立刻动身，千代婆婆也自告奋勇要一起去。然而，晓也获知了卡卡西与阿凯等人的行动，而分别派出了鬼鲛和宇智波鼬去应战……

卡卡西跟阿凯小组虽然已经抵达我爱罗所在的石洞外，但碍于洞口有五封结界，还是无法将我爱罗救出，于是在他们的同心协力之下终于进入洞穴里，但是……

随着千代与小樱跟蝎正式展开对战后，远在砂忍者村的勘九郎也带着从国境赶回来的手鞠一行人，出发前去救我爱罗……。然而，时隔二十年的祖孙重逢，除了没让千代奶奶感到喜悦之外，甚至还从蝎的收藏品中，发现了更惊人的秘密……。

眼看着小樱就要被困在蝎施放的毒气中而无法脱身时，昔日的约定让小樱决心不顾一切也要活下去，后来在引爆符的威力下总算脱离毒气的纠缠。然而，千代面对丝毫不示弱的孙子的攻击，最后也不得不拿出预藏的傀儡来对付蝎……。

眼看着没办法轻易解决掉小樱与千代的蝎，只好再拿出绝招来对付她们，那就是第三代风影最令人害怕的忍术——铁矿砂，此举的确让千代吃足苦头，但也因此激起了小樱来自纲手的不服输个性……。此外，随着蝎年幼时所打造的父母傀儡的出现，也让千代回忆起蝎小时候企盼得到父母之爱的往事……。

小樱打算利用三分钟解毒药效打败蝎，虽然最后看似成功，但蝎的本体却在紧要关头寄生到别的傀儡上。此举让千代决定用已封印的忍术，结束眼前的这场傀儡战斗剧，没想到在召唤出十个傀儡后，蝎竟更上一层楼地召唤出一百个傀儡，一场傀儡大战于是就此展开……

就在小樱以为已打败蝎的时候，蝎竟然利用其他傀儡的躯壳复活了，而且还在小樱想救千代的时候给了小樱致命的一击，虽然如此，小樱在千代的治疗与转生忍术的帮助下，总算捡回一命。而蝎则是因为千代的攻击而丧命，却也因让千代说一个她心中再也无法实现的梦想……。

虽然阿凯他们已经察觉也确认小樱她们打败了蝎，但是四人仍然身陷于对手的术之中，不但没有打败对手的迹象，体力甚至开始出现疲态，后来在小李的激励之下，总算将难缠的对手给解决掉……。

当鸣人发现我爱罗已死时，心中的愤怒瞬间爆发，九尾的查克拉也从体内渗漏出来，卡卡西见状赶紧拿出自来也交给他的符咒往鸣人的额头上贴，总算是平息了鸣人的情绪……

千代婆婆与小樱跟卡卡西一行人会合后，便开始对我爱罗施行忍术，小樱也终于明白千代婆婆所提到她非做不可的事为何，原来她要利用转生忍术让我爱罗起死回生，但是代价就是得牺牲自己的性命……

在卡卡西一行人的努力与千代婆婆的牺牲之下，总算是把我爱罗从鬼门关前救了回来，他们也受到了砂忍者村的热烈欢迎。卡卡西一行人决定立刻出发回村子里，向火影大人报告最新的情况……

小樱向纲手报告蝎在临终前说出的情报后，纲手决定派卡卡西小组一行人前往探查真相。除了要补足一名小组成员之外，还得安排暂时带队的队长，鸣人立刻到村子里寻找适当的人选……

木叶的两位顾问为了鸣人的事找了纲手协商，最后纲手不得已只能接受他们的要求，启用他们选派的一名新人安插在卡卡西小组里面，而代替卡卡西职务的人选，则是由纲手亲自挑选……

鸣人和小樱都无法接纳祭，以致卡卡西小组迟迟无法整合。为了统合小组的战力，大和不惜自掏腰包招待鸣人他们住宿温泉旅馆，同时他也以胁迫的方式让大家能暂时维持表面上的和谐……

在大和的威胁与利诱下，卡卡西小组总算是有了表面上的整合效果，然而祭却还是无法与鸣人他们打成一片，小樱虽然发现祭在绘画方面的天份，但是却又从祭的绘画中看到了诡异的气氛……。随着时间的逼近，大和为了顺利执行任务与更深入的了解蝎，于是召开行前会议，目的就是为了能生擒那个蝎派遗到大蛇丸身边的间谍……。

大和在分组之后，立刻展开始模拟战斗训练，从训练中发现鸣人跟祭的关系仍然无法改善，以及祭的实力超乎他当初的想像。虽然鸣人跟祭似乎有点水火不容，但鸣人跟小樱后来都决定，只要能够救出佐助，他们都愿意与祭联手合作……。

大和在做好行前准备后，便乔装成蝎的模样前往天地桥赴约，但令人惊讶的是，晓派去的间谍竟然是药师兜。然而更让大和他们跌破眼镜的，则是大蛇丸也现身了，在情势所逼的情况下，大和决定叫鸣人他们三个人一起现身……。

大蛇丸现身后，小樱他们他在大和的一声令下一起出动，没想到鸣人竟然因为大蛇丸的挑衅而出现妖狐外衣外漏的现象，甚至在短时间内就已达到三条尾巴之多，而大蛇丸也在此时说出，他人还在木叶时跟大和相关的一段过往……。

鸣人禁不起大蛇丸的挑衅，决定与体内的九尾妖狐妥协，不惜出卖自己的身体换取更强大的力量，鸣人虽然因为这样在与大蛇丸的打斗中占上风，但是也因此重创了自己的身体……

眼看着鸣人的变化，小樱忍不住想前去阻止，虽然大和立刻采取行动，但小樱的手臂仍被九尾的查克拉所伤，大蛇丸也因为肉体产生排斥作用而准备撤退了。鸣人在大和的抢救下慢慢恢复了……

在大和与小樱帮助鸣人治疗的同时，祭趁机执行段藏所指派给他的任务，而前去与大蛇丸交涉。鸣人在清醒之后，完全不记得发生过的事，而小樱则是听了大和的解说后，了解了整个战斗的来龙去脉……

大和的木分身在追踪的途中发现了祭的尸体，而另一方面，鸣人清醒后，身体似乎并未完全复原，被九尾的查克拉伤害的小樱，情况也好不到哪里，大和决定要让鸣人知道真相……

当鸣人知道伤害小樱的真凶就是自己时，内心感到相当错愕。大和要鸣人别依赖九尾，要用自己的力量去拯救伙伴。另一方面，小樱看到祭的绘本后，对内容所描述的奇妙故事产生了疑问……

祭在大蛇丸的根据地里，与佐助有了一场战栗的会面。另一方面，鸣人和小樱吞下了大和所交付的神秘种子之后，三个人便利用土遁术潜入了大蛇丸的巢穴，展开救出佐助行动……

在大和的带领下，他们终于找到了祭的所在之处。在质问他关于“毁灭木叶计划”的事情时，祭也很干脆的说出了事情的原委。而小樱将祭所遗失的绘本归还给他后，也指出了隐藏在他行动中的矛盾心情……

祭听了鸣人的心声后，稍微懂了“伙伴”以及“牵绊”所代表的意义，他为了守护鸣人的那份友情，决定放弃原本的任务，改帮他们去寻回佐助……

鸣人虽然因为旧伤而感到吃力，却不愿意停下来休息，祭看着这样拼命的鸣人，也回想起了重要的回忆。但就在此时，大和也发现了祭的极秘任务的真相……