这天历史学家内特.海伍德博士去找了星城市长奥利费.奎恩，海伍德告诉奎恩说传奇小分队被困在了1942年。海伍德和奎恩在大西洋海底找到了时间飞船乘波号，但是传奇小分队都不见了，苦苦寻找后他们在一个角落发现了沉睡的罗里。罗里告诉他们在时间中有人在刻意破坏历史，他们的任务就是保护历史，铲除坏人。达克绑走了米列娃，得到了原子弹。传奇小分队上前阻止，但是没能成功。就在达克想要炸毁纽约市时，船长里普.亨特用飞船挡住了原子弹，还将大家送到了不同的年代，自己却牺牲了。

美国正义协会将传奇小分队带回了总部关押起来，传奇小分队将他们经历过的事情一一讲给正义协会，但是并没有取得正义协会的信任。这时正义协会成员钢铁司令出现了，海伍德给钢铁司令讲了有关狗牌的事情，才获得了正义协会的一点点信任。

杰克逊和马丁再一次去了秘密船舱，他们商量着要不要将听到的消息告诉莎拉他们，因为世界大战就要来临了。这时莎拉紧急召唤所有人开会。传奇小分队收到了时间之主的消息，正准备前去营救他。这时从远处传来了一个人的呼救声，他们救下了这个男人。就在他们要离开的时候出现了一帮丧尸，一番打斗他们才虎口脱险，但是那个男人却死了，罗里也受了伤。杰克逊决定和阿玛雅分头行事。杰克逊潜入了庄园 ，丧尸充满了整个庄园。杰克逊带着大家杀出了一条血路，一把火烧掉了整个庄园，而且还得到了地图。受伤的雷正在慢慢转化，就在雷想要给罗里注射药物的时候罗里已经转化成丧尸了。

这天杰克逊和马丁正在争论，杰克逊想要凭借他们的力量将历史改变的好一些，但是马丁认为这会造成更大的危害。另一边罗里正在教雷使用他们的武器，两个人的默契越来越好了。海伍德在整理飞船上的东西，这时阿玛雅劝告他不要和成员深交。而另一场挑战正在路上，有人想要阻止1987的华盛顿的核条约签定。传奇小分队去了1987年的白宫，阿玛雅和海伍德一起去了美国正义协会学院。眼前的场景将阿玛雅吓了一跳，因为这个学院根本没有任何人，还破败不堪。

传奇小分队回到科罗拉多，海伍德，杰克逊和雷他们三个负责找出特布尔统治西部的原因。海伍德三人见到了特布尔，他们假装自己是联邦政府的公务员，在和特布尔谈论间他们知道了特布尔开发了一座矿山，他们决定前去看看。海伍德他们混进了矿山，雷在矿山发现了很多稀有的矮星合金。罗里和阿玛雅混进了特布尔的酒馆，罗里遇见了特布尔并成功地激怒了他。双方打了起来，战斗中罗里差点被特布尔杀死，但是还好海伍德替他挡下了子弹，但是因为子弹是用矮星合金制作的所以海伍德也受了重伤。

传奇小分队回到了2016年的中城，他们和超女，闪电侠，绿箭侠等超能力者见了面。这次不是群众遇见了问题，而是他们自己面对着危险，因为外星人将他们当成了敌人。海伍德抓住了和外星人交流的机会，这时他们才知道外星人来地球就是为了除掉像他们这样的超能力者。费莉希蒂和西斯科前来救走了海伍德他们，他们还救下了外星人并将它送回了它的星球，因为他们以为这样做外星人就会感激他们。在送外星人走之前西斯科拿到了能和那个外星人保持联系的仪器，几天后外星人发来了消息说：它很感激他们救了它，但是它们仍然会杀尽所有超能力者。

海伍德和雷假扮成爱略特及其同事去见了探员科尔，他们告诉科尔说卡彭的地下酒吧里私藏了很多加拿大威士忌。卡拉、杰克逊和马丁去了那间酒吧。卡拉他们在酒吧遇见了达克他们，达克将卡拉和马丁抓走了，还好海伍德和雷及时赶到，不然杰克逊也会被抓走。大家回到了飞船商量对策，罗里很是不看好大家的办法，他要求大家按照他的方法来营救卡拉他们。被抓的卡拉见到了梅林，现在梅林已经是达克的伙伴了。梅林想要和卡拉做笔交易，只要卡拉将护身符交给他那么他就放了卡拉，并且还让卡拉回归正常的生活，显然卡拉并没有答应他的交易。这时马丁将自己造成的时间偏差告诉卡拉，卡拉不能理解马丁的自私，因为是马丁教会了她为大局着想。

传奇小分队本想救走亨特船长，但是亨特因为电影拒绝了和传奇一起离开而因此引来了警察。传奇和达克都逃走了，警察带走了亨特。回到飞船的莎拉想明白了一件事情，那就是亨特身上有圣矛。马丁假扮成了一名心理医生去了警局，他们顺利的见到了亨特。但是亨特却一直不承认他就是亨特，他告诉他么们亨特只是他电影里的人物，还好他们带着亨特回到了飞船。吉迪恩诊断了亨特，他们发现亨特并不是忘了他是亨特而是他的大脑发生改变。吉迪恩还告诉他们亨特在离开飞船前取走了一块木头，他们猜想那就是圣矛。海伍德和雷发现他们从片场回来之后记忆便在消失，就此大家才找到了真正的时间偏差，那就是已经从电影学院退学的导演卢卡斯。

达克和梅林成功的潜入了银行打开了保险箱，这时极速者出现了。这正是达克和梅林想要的，他们关上了银行的门，阻止了极速者的逃跑。没有办法的极速者只有将自己的秘密告诉了他们，原来有极速者的祖父想以自己自杀来抹灭极速者的存在，而从那之后便有一个东西一直在找极速者并且想要杀了他。达克他们和极速者做了笔交易，那就是他们帮他解决那个东西然后他们做真正的伙伴。他们将保险箱里的东西带回了营地，那个东西便就是亨特的所有的记忆。

亨特带着士兵试图将舱门打开，终于他们打开了舱门。一上飞船的亨特便到处找东西，而飞船上能够战斗的人就只有杰克逊了。亨特试图和杰克逊做笔交易，他希望杰克逊将圣矛给他，这样他便可以救回杰克逊的父亲，但是杰克逊拒绝了。杰克逊终于修好了飞船，但是亨特以卡拉为要挟逼杰克逊交出了圣矛。杰克逊不能理解卡拉为什么这么做，为什么卡拉还要保护亨特。但是卡拉告诉他她这样做是在保护他。关键时刻海伍德他们出现了，并成功地救出了华盛顿和罗里。他们虽然修好了飞船，救回了华盛顿，当时仍然没有守护好圣矛。

战争已经开始，每个人都竭力和亨特他们拼搏着。这时候罗里开始发力，每个士兵头上的控制器都开始坏损，亨特失去了对士兵们的控制。处于劣势的达克抛下了亨特独自逃跑了，雷追上了达克，两个人大干了一架，但是最终达克还是逃跑了。传奇小分队成功制止了亨特他们，而且星女还将圣矛交给了阿玛雅保管，而她选择了继续留在这个虚幻的王国。

关键时刻亨特自己将邪恶的传奇小分队消灭了，亨特的大脑正在崩塌，卡拉和杰克逊回到了现实。亨特本可以和他们一起离开，可是吉迪恩却将永远的被困在亨特的大脑里。在吉迪恩的劝说下亨特终于愿意回到现实，临走前他们给了对方一个离别的吻，那个亨特船长又回来了。亨特虽然回到了以前，但是那段不好的记忆也留在了他的脑海里。虽然大家表示不介意那段回忆，可是这终将成为他心里的疙瘩。

现在最大的一个问题就是大家怎么回地球。雷只有选择和极速者合作找到乘波号，他们找到了乘波号，但是现在乘波号也没有多余的燃料。马丁告诉卡拉他们必须选择关掉飞船上的非必需仪器来节省能量，而且还得找到一个合适的角度来突破大气层。极速者告诉大家38度是最合适的角度，大家选择了相信极速者，毕竟他来自22世纪，他也想回到地球。但现在最麻烦的是因为大气压的关系他们没有办法将角度调到38度，卡拉和亨特都打算牺牲自己去打开货舱门来调整角度，这时他们发现亨利不见了，亨利牺牲了自己将大家送回了地球，这样他的使命就真正的结束了。

传奇小分队回到了飞船，大家都很担心罗里，因为如果让他选择他肯定会选择史内特。约翰找到了耶稣血的下落，但是现在还缺一个人来控制圣矛，阿玛雅自告奋勇，而大家选择了相信她。他们到了战场，一方去说服德方停火，一方说服法方停火，可是都没有成功。没办法他们只有冒着战火去战场中心找寻耶稣血，就在这时亨特打晕了法方指挥官，他私自下令停职了战争。就在他们找到耶稣血的时候达克和史内特出现了，罗里带着圣矛投靠了末日军团，耶稣血也在战乱中被损坏了。

卡拉回到达克那里，她想要帮助阿玛雅和杰克逊他们回复记忆，可是达克发觉了卡拉的不对劲。还好卡拉帮助阿玛雅回复了记忆，她们顺利的逃跑了。卡拉他们又找到了杰克逊，他们也帮杰克逊找回了记忆。马丁按下了求救信号，斯旺赶到了现场，达克他们也赶到了现场，现在达克是和卡拉他们一队的，因为他们都不想斯旺毁掉圣矛。在战斗过程中阿玛雅牺牲了，但是就算如此他们还是没能阻止斯旺，圣矛就这样没了。而此时的亨特正在想办法向传奇小分队发出信号，这样他们便可以回到事情开始的那个时间阻止斯旺。

卡拉决定由1916年的传奇小分队带着圣矛离开，未来的传奇小分队打掩护。可是就在这个时候，达克他们出现了，他们开始炮轰飞船。传奇决定先离开，可是这时候时震出现了，他们谁都没有办法。在战斗过程中未来的传奇都死掉了，除了卡拉。此时更糟糕的是斯旺也出现了，而且不仅一个斯旺，而是一群斯旺。亨特将圣矛交给了卡拉，他决定让卡拉去使用圣矛，因为他相信卡拉的内心。卡拉开始启动圣矛，她看见了死去的姐姐，但是她没有贪婪于自己的小心思，而是顾全了大局。卡拉用圣矛叫来了斯旺的死敌，就这样斯旺死了，达克他们也被抓了起来，他们做到了。