泰国曼谷，12岁的秀贤在巴士里一直目不转睛地看着智友，下车后他接过朋友捡到的智友的钱包。永吉和慧善告诉智友希望能和她一起到自由的地方生活，两个人的内心涌起暖流。秀贤把钱包还给智友，两个人越来越走近。到达曼谷的NIS室长钟浩与泰国检察厅的检察官京华一起开始调查青帮组织。钟浩和京华对永吉表示可以帮助他离开泰国，并提出危险的建议，但永吉迟迟不敢下决心。智友把秀贤介绍给马奥，马奥教秀贤握手的礼节。永吉与马奥大吵一架，之后永吉把一文件袋交给了京华，钟浩把三个人的假护照和身份证递给了他。智友流着泪告诉秀贤自己今天要离开泰国。

　　智友送给秀贤和民基一幅画，让他们挂在办公室里。秀贤说还有会议，起身离开。民基把画转交给秀贤，说智友喜欢秀贤。永吉在打网球时看到了玛奥，并告诉他慧善已过世的消息。马奥听着智友的声音，眼神忍不住颤抖，呆呆地望着远去的智友的背影。秀贤对智贤表示自己不可能成为超过友谊的关系，对她表示歉意。智友告诉秀贤谢谢他的晚餐，之后先行离开。在承柱的指挥下，海外一组准备着作战计划。马奥给千会长厚礼，希望他能出面帮助自己。秀贤穿着服务生的衣服走进房间，刚要把偷听器放上去，突然秀贤看见马奥，整个人僵硬住。秀贤靠在墙壁上痛苦地闭上了眼睛，随后他藏着手枪跟随马奥离去。

　　秀贤到达曼谷，乘坐一辆出租车离开，智友跟随秀贤也到了曼谷。秀贤找到阿华表示想找青帮管辖的娱乐场所，并和他一起坐车离开。秀贤拜托民基从泰国得到的资料中与青帮关联的资料。智友问秀贤发生了什么事情，秀贤犹豫着说自己要见一个人。秀贤和智友一起在海边度过快乐的时光，还一起去了小时候住过的地方。秀贤来到阿华告诉的夜总会，在那里遇到了托尼，让他安排自己与马奥见面。民基接到智友的电话，智友告诉他联系不上秀贤，民基吃惊。民基对钟浩坦白秀贤在泰国的事情。民基与边氏一起去曼谷，秀贤被绑在水上监狱的柱子上，遭到一群打手的狠打。

　　秀贤从泰国回来后找钟浩谈起自己的父亲，钟浩安慰他。郑部长告诉秀贤如果他表现好的话，今后还会回到NIS，并提出当卧底的建议。智友把木头雕塑递给秀贤，秀贤望着智友，突然从后面抱住了智友。听到秀贤突然死去的消息，智友忍不住痛哭，民基在一旁拼命忍着眼泪。两年后，民基把正在相亲的智友带出来，两个人说起秀贤都感到不自然。在泰国拳击场上，秀贤正以漂亮的身手把对手打倒在地上，阿华在一旁兴奋地鼓掌。民基被派到海外1组，他推荐边氏作为此次事件的负责人。

　　永吉带着智友参加网球聚会，并把她介绍给千会长，相植在一旁默默地看着智友。马奥决定接受托尼的邀请，去看看拳击比赛。Kay听到青帮的老大来看比赛的消息，决定参加比赛。 马奥上前给胜利者颁奖，这时一个杀手拿出枪射向马熬，Kay飞身救马熬，并抓住了杀手。民基看着智友仍然戴着秀贤的手表，内心感到失落，但表面装出无所谓的样子。Kay来到韩国，向钟浩报告马奥的行踪。坐在车里的Kay痛苦地看着从公司出来的智友。

　　来到泰国的民基看着智友仍然带着自己送的手表，不禁大吃一惊，智友害羞地笑了起来。BS成立纪念活动现场上，文司机慌忙走到马奥身边，Kay的目光警觉地跟随着他们。看着智友和民基亲密的样子，Kay内心绝望地看着。Kay藏起手枪与马奥谈话，他看到智友小时候的照片，整个人呆住了。马奥拜托Kay保护智友。智友来到机场，一个一个地检查画，Kay远远地注视着她。

　　阿华看到Kay感到很高兴，但失去记忆的Kay表示自己无法相信任何人。内心混乱的智友陷入了沉思，民基为了让智友散心，把她叫了出来。永吉对马奥嘱咐智友的安全。穿着便装的边氏来到了马奥的大厦。在展示会上，智友看到与秀贤相似的男人的背影，于是跟了过去。郑部长找到边氏，表示自己已经知道他是在帮钟浩盗听马奥的行踪，令他把汇报给钟浩的事情也同样要汇报给自己。智友认真地画了一副男人的话，说这个人是自己的救命恩人。Kay给马奥打电话，让他来相植告诉的地点。

　　民基总想得到青帮和蜘蛛派的资料以翻查仁川码头一案。上司得知其举动后，严厉责备了他。卞东石把窃听到的通话传给钟浩，钟浩惊讶地发现雅丽就是智雨——民基和秀贤爱的女人，也是马五的女儿。马五的情妇小蜜约智雨见面，地点在卞东石开的国餐厅，Kay替阿华把拿东西过去。智雨不断追问Kay家里的事，发现他与秀贤的性格截然不同。Kay说自己视马五为父亲，责备她对父亲的冷漠。卞东石窃听了他们三人的谈话，把情况告知了钟浩。Kay在百货公司见到养父也无动于衷，后来以为钟浩跟踪他和小蜜，拉着小蜜逃跑。看到Kay不是秀贤，智雨私下伤心透了，但是却故意加快与民基的交往速度，提出到他家拜访其父母。钟浩私下向智雨坦言他知道她的父亲是是谁，不适合与身为国情局要员发展感情。智雨伤心地离开。民基不明白父亲对智雨说了什么令她如此伤心，与父亲发生争吵。Kay发现公司内被装了窃听系统，他决定把安装的人引出来。国情局的人得到马五故意放出的消息，说是让Kay在影院进行交易，于是NIS布局准备逮捕Kay。钟浩怕秀贤会被伤，擅自行动打算把失去记忆的秀贤救回来，秀贤顿时愣住，钟浩却被赶来的裴常植从背后刺了一刀。钟浩身亡，民基以为Kay杀死父亲，从此视他为仇人。

　　钟浩的死不仅为家人带来巨大伤痛，而且令卞东石万分悲痛。眼看郑甲洙对手下的死没有半点恻隐之心，卞痛骂了他。郑却说他的哀悼方式不同罢了。马五亲自约见郑部长，请求他放了Kay，郑答应了他。对Kay被释放一事，NIS组长感到非常疑惑。马五的公司投资徐英吉的公司，智雨见到生父前来与父亲洽谈生意感到很担心，问父亲马五的投资是否有问题，父亲却对她说没什么。卞再次痛斥郑部长为案件不顾死活地利用秀贤的行径，恐吓地说要把秀贤的卧底身份说出来，不料郑反过来用当年卞在泰国因为钱出卖了情报，间接导致秀贤母亲身亡的事来威胁他，并要求他负责民基，不要让他影响到青帮的案子。蜘蛛派欲再次暗算马五和他的亲信，Kay和智雨在一起时被偷袭，看见Kay残酷地疯狂殴打偷袭的人，智雨震惊万分。民基被为内勤，他满心忿忿。而默默关心他的明才帮他在NIS盗取到了青帮的资料。民基擅自跟踪蜘蛛派的人。智雨在卞的餐厅帮Kay包扎伤口，Kay的一句话勾起了智友的伤心回忆。这时民基来到餐厅卞，却看见智雨与Kay一起。

　　看见智雨和Kay一起，民基怒火冲天，幸好东书拦住了他。民基因此事责怪智雨，并提到秀贤，智雨生气地离开。民基从明才那里获得了青帮活动的资料，并带她到卞东石那里。卞警告民基要有随时脱掉NIS制服的心理准备。日道发现民基和明才的举动，原本抵制的日道也加入了民基他们。Kay看见智雨和他谈公事时神不守舍，一把拉了她去散心。两人一起骑马时，智雨想起以前与秀贤在泰国海边骑马的情景。智雨把与他长相一样的爱人因车祸死去的事告诉了Kay。早已认定Kay是杀亲仇人的民基跟踪Kay，也见到了与Kay共事的智雨。民基也惊讶地发现智雨是马五的女儿。他马上去指责智雨竟向自己隐瞒此事。智雨愤怒地告诉他，马五是不是她父亲不是她可以选择的。NIS全体出动到码头稽查青帮托运的货物，结果扑空了。跟踪Kay的民基得知后，认定被送往度假村的那批装饰品内藏有毒品。他下车冲进去，疯狂地撬开箱子，任凭智雨如何劝说也没有用，而Kay只是站在一旁悠闲的吹着泡泡糖。结果被打开的箱子里都是正常的装饰品。智友冲动地给了民基一巴掌。其实毒品就藏在Kay身边的一个小箱子内，整理时Kay命人秘密地把它带走了。

　　郑甲洙短信问Kay“做好野游的准备了吗”，让Kay到美术馆地道，里面播放着李秀贤在NIS里工作的录像。Kay看到录像，听着电话那端郑甲洙说着莫名其妙的话，愤怒起来。Kay向智雨打听李秀贤的事。Kay把事情告诉了马五，说NIS想借他失忆，说他是NIS的一个黑色要员。他问马五是否还信任他，马五告诉他，一起出生入死过的男人之间没必要再谈什么信不信任，因为已经是一体了。智雨发现亲马五真利用了她贩毒。她知道父亲向她隐瞒了许多事，她劝父亲要正视问题，不要再被青帮利用。徐英吉答应了，遂把资料交给了民基。NIS凭借此沉痛地打击了青帮。Kay找到卞东石，要他把有关李秀贤的情报卖给他，卞征得郑部长同意后把一些情报给了Kay。Kay看完录像，震惊地发现李秀贤的手表和他自己的一模一样。Kay激动来找智雨想求证手表的事情，同时，民基带着花正好来找智雨和好。民基见Kay激动地抓这智雨，立即愤怒地暴打Kay。在智雨的阻拦下，Kay茫然地离开。Kay好像越来越害怕知道真相。郑部长让Kay来“野游”，这次Kay更为震惊地得知，被裴常植杀死在自己眼前姜室长居然是自己的父亲（养父）。组织命令马五杀掉徐英吉，Kay主动请愿。Kay射杀徐英吉之时，智雨冲出来挡在枪前令Kay想起了一切。Kay开车撞向路边隔离带，爬出车的Kay彻底崩溃，痛苦无措中，Kay掏出自己的手枪，指向自己的太阳穴…

　　就在这时，不知何时被摔出的手机振亮，Kay看着手机……然后拿了起来。卞东石约Kay见面，说是有关李秀贤，有话和他说。Kay已经在崩溃的边缘，激动地用枪指着卞，怨恨卞当初为什么不管自己，以致自己替马五做了很多伤天害理的事。Kay孩子般的跌坐在地上痛哭“我爸爸呢，叫我如何去面对死去的爸爸是我是我杀了他”激动不已的Kay立即拔枪要自尽，幸得卞一把按住，枪打偏，Kay痛苦地喊着。卞东石把Kay带到情报局及青帮都找不到他的地方，帮他伪造了护照，准备陪他离开韩国重新生活。秀贤在机场被郑部长的手下强行抓了回来。郑甲洙用秀贤生父引诱秀贤回到青帮继续做卧底。秀贤回到青帮，鼓动马五只有杀死青帮总头目张大人，智雨才能真正安全，马五同意了。Kay亲手杀死了张大人。马五此时稳坐青帮第一把交椅。郑部长责怪秀贤去泰国前不汇报，他以后有事要先汇报，不能再像这样失去联系，而秀贤则告诉他，鼓动马五杀了张大人的正是自己，郑知道秀贤是要为父母报仇，秀贤还告诉他，下一个目标就是裴常植。郑警告他不要为了报仇惹来祸事，秀贤则表现得完全是Kay。智雨担心Kay，来找他，问他向她父亲开枪的是不是他，还有他是知道手表的事。Kay刻意表现得非常冷淡，并告诉智雨没有必要留恋破手表和大象雕刻。智雨根本没有跟任何人提起过大象雕刻的事情，她知道Kay就是秀贤，跟着Kay追出去。Kay强吻智雨，好让她放弃Kay就是李秀贤的想法。跟踪着Kay的民基把这一切都看在了眼里。民基因跟踪秀贤被裴常植发现。裴常植灌他吃大量毒品，民基神志不清，见到Kay猛喊秀贤。为保护民基，Kay自己动手打民基。

　　秀贤说是要把民基和他的东西一起埋了，把神志不清的民基带了出来，来到卞东石的地方，让卞好好照顾民基。为了秀贤不被发现，这段时间民基必须躲起来。马五到徐英吉的公司告诉他以后青帮不会再干涉他的工作，因为张大人已死。离开时，智雨把秀贤拉住，告诉他，就算他怀疑整个世界也要相信她，她是站在他那一边的。民基醒来后，卞把秀贤的事告诉了他。无法接受现实的民基见到赶来的秀贤，冲上就打，拔枪指着秀贤。看着一心求死的秀贤，充满了怨恨和不忍，对天开枪。兄弟毕竟是兄弟，比起怨恨，对于秀贤，民基更多的是担心，他告诉秀贤不会让他孤军奋战。马五从内应那里知道了民基还活着，开始对秀贤有所怀疑，派人跟踪他。秀贤怀疑情报局内有奸细告密。透过秀贤帮助，民基发现了奸细金政宇。裴常植与文理事在小蜜的鼓动下，打算合谋在仓库杀掉Kay。阿华知道秀贤有危险，因为小蜜，联络不到马五。情急之下找了智雨，智友不理民基劝告，执意要去仓库。待智雨赶到现场时，秀贤已被打得浑身是伤，智雨冲上去护着Kay。裴常植原已碍于智雨的身份打算离去，却听到智雨喊着“秀贤”，转身拔枪对准了秀贤他们，枪声响起……

　　幸好民基及时赶到，秀贤和民基一起与裴尚植他们发生枪战。民基跟着裴常植追了出去，而秀贤却也没什么力气跟着追出去，只是拿着枪护着智雨。裴常务逃跑，告诉文理事Kay就是李秀贤，文理事不以为意，因为马五已经为Kay被偷袭而大发雷霆。民基送秀贤和智雨来到卞的地方，然后自己离开。智雨细心地照料着秀贤，并劝他结束这危险的任务，秀贤不依。智雨来到马五家中，她请求马五离开韩国回泰国去，马五不答应。秀贤愤怒地载智雨离开，智雨求秀贤把任务交给其他人完成，她害怕总有一天，秀贤和马五中至少有一个人会出事，悲伤痛哭，秀贤把智雨揽入怀里。BS Enterprise借举办慈善拍卖会进行毒品生意洽谈。智雨突然出现，正执行监视会场状况任务的民基担心智雨，迫不得已之下离开工作车与智雨一起进场。得到卞东石及民基的帮助，秀贤窃取了青帮与多国毒品交易进程及生产地的相关资料。行动中秀贤差点被发现，卞为他捏一把冷汗。裴常植突然来到会场，意要杀掉Kay报仇，跟踪Kay，正当他拔枪欲杀之时卞东石扑上去制止了他。争执中裴常务把卞杀死，赶到的民基杀了裴常植。青帮在韩国生产毒品的基地被彻底查封，所有交易失败。马五离开会场时，跟在背后的秀贤拔出了枪对准了马五。这时智友出现，秀贤开枪了……

　　（大结局）马五带着智雨、秀贤和Giraffe来到别墅，智雨不安地看着秀贤。承柱告诉郑部长卞的死讯，郑部长缓缓地转过身。秀贤告诉智雨很危险，叫她先回去，自己还有未做完的事情。郑部长让民基说服秀贤拿到U盘。拿到U盘的秀贤叫醒智雨，问她愿不愿意和自己一起离开。两人一起回到卞的餐厅，过了温馨、甜蜜的一晚。睡梦中的秀贤被手机震动吵醒，看着怀里的智雨，他拿起了手机基抱着秀贤的大腿都没能阻止秀贤。秀贤来到仓库，Giraffe让秀贤离去，他会护送马五马五发现秀贤手上的手表，想起以前第一次听从组织杀的人是自己最最要好的朋友李东柱。原来秀贤是这个好朋友的儿子，马五也崩溃了，抓住秀贤拿着的枪，告诉他，他是自己的儿子——Kay，现在他也想休息了，然后扣动了扳机民基和明才有了宝宝在雨，智雨打算到巴黎去。日本，秀贤继续一黑色要员的身份完成了一项任务，把一样东西交给了他的负责人姜民基，民基还告诉秀贤，不管他申请哪个地区的黑色要员，都休想换负责人，让他快说要到哪个地区去。秀贤告诉他，下一个任务，Spy的乐园——巴黎。智雨揭开了「狗和狼的时间」的那幅画，“从那时起，那位少年度过了漫长的旅行，从一个愿望到另一个愿望，直到他找到真正的自己。”夕阳下，“傍晚时分，一切事物都被染红，从远处飘过来的幻影，是我养的狗呢，还是来害我的狼，是难以分辨的时刻。在这一时刻，善和恶也都是红色，”秀贤看着自己的表，走在夕阳下……