宫中有人遇害，太平暗指隆基是主谋。何离、三恕到霓裳阁重组案情，有所发现。琼香要四司交代当晚在霓裳阁发生的事，又命四司交出霓裳阁钥匙以证清白……何离、三恕认为琼香有嫌疑，四司同心为琼香辩护，王蓁突然现身力挺琼香。元玥被收押掖牢，与同囚的司设房女史甘若芊同病相怜，成为朋友。三恕、何离发现新线索，二人到太医署查问时，却发现太平已派人取走证据。大殿上，太平直指隆基隐瞒案情，并凭此在大殿之上指出疑凶！

众人惊愕于疑凶身分之际，三恕作证助洗脱嫌疑。思源求见芳媚，指控琼香有杀人嫌疑和动机。芳媚前赴尚宫局审问，琼香坚称有真凭实据可证清白。太平认定隆基与凶案有关，及后竟发现凶案的惊人真相。三恕与何离发现司珍房有人相当可疑，随即到尚宫局调查，司珍徐相思发现疑人早已不知去向。太平向隆基开出交换条件，要求隆基终止调查。隆基向天立下血誓，烙印他称帝的决心。元玥脱罪获释，离开掖牢时竟发现与姊姊殷瑈有关的记号……

何离将重伤的元玥送往太医署，元玥苏醒后误会救回自己的人是内侍监成恭，反而得悉被囚掖牢全拜何离所赐，元玥表明与何离誓不两立。何离巡逻时突遭刺客袭击却临危不乱，隆基欣赏他智勇双全，并擢升他为参军。隆基得悉李旦有意册立成器为太子，决定先发制人，令成器主动推辞。隆基最终如愿以偿，当上太子。王蓁成为太子妃后，接管后宫事务，欲施仁德，建声望；她打算将荒废多时的回心院清拆复修，供尚宫局使用，却遭到太平阻拦……

元玥伤势好转，向成恭道谢同时，竟迫使成恭助她升为司设房女史。元玥请求何离助若芊脱罪，期间巧遇隆基。经三恕、何离调查后，终还若芊清白。琼香与四司商议回心院用途，四司互相推诿。元玥从女史们口中得知，回心院曾作幽禁之用，更不时传出人声。王蓁与太平为清拆回心院一事，各不相让。太平向李旦动之以情，终取得不拆回心院的圣旨。太平得圣旨后咄咄逼人，更当众揶揄王蓁。王蓁尴尬之际，幸有人挺身而出，为她解围……

太平得知三恕贸然清拆回心院围墙，愤怒不已，要治其死罪；隆基出现解围。攸暨试图安慰太平，反勾起太平对他的怨恨。尚宫局众女史宫婢远窥龙武军雄姿，若芊更被三恕深深吸引。司制陆碧云赶离众人时，与司珍徐相思狭路相逢……若芊为元玥打探到殷瑈在一年前离开掖牢后失踪，元玥潜入回心院一探究竟，途中听到殷瑈所教的童谣。元玥走至回心院小屋，突然遭一黑影迎面袭来，幸得尾随而至的何离所救。同时，小屋内的骇人场面震慑二人……

王蓁查出在回心院寻获的女子，乃多年前失踪的女史吴翠莹，又发现尚宫局知情不报……太平得知翠莹被人带离回心院后大为震怒，攸暨始知翠莹被囚一事与太平有关。元玥发现翠莹认识殷瑈，唯问及回心院之事时，翠莹突然情绪失控……隆基将翠莹冤屈被囚一事上报李旦，李旦下令要对真凶杀无赦，隆基直指真凶就是太平。太平反指隆基借翠莹之事，意图排除异己。王蓁带同证据上殿，力证太平恶行。李旦陷入两难之际，有人挺身而出担起罪名……

太平脱罪，并往牢房探望为她顶罪的人，却遭顶罪人冷漠相待；三恕却看出顶罪人别有用意。太平得悉顶罪人长久以来隐藏的秘密，并赶赴刑场力图阻止顶罪人问斩……隆基奉李旦之命拜访太平，太平与隆基针锋相对，二人表明分道扬镳的立场。元玥欲从司膳汪敏处问出殷瑈下落，遂向成恭借钱买饰物作讨好之用，却被成恭狠狠赶走；何离见状大方借钱相助。李旦出宫视察先帝皇陵，突遭蒙面刺客袭击，幸三恕及时护驾，并率部下与刺客连番缠斗……

隆基查悉刺客目的，乃为报文泉书院灭门之仇，隆基奉李旦之命捉拿刺客。三恕设局试探，确定何离与文泉书院大有关连。何离道出事情始末，并求三恕帮忙，事后任凭处置；三恕相信何离。太平在宫中举办祭礼，太平竟突然袭击王蓁，幸得元玥挺身相护。王蓁欲接元玥到武德殿休养，却被太平捷足先登……三恕查出文泉书院灭门案内情，何离半信半疑；此时太平的部下前来，声称要捉拿刺客。何离以为事情败露，未料太平矛头所指竟不是何离……

太平所指疑凶百口莫辩之际，隆基急中生智，为其解围。何离向隆基请罪，隆基的决定令何离感动。若芊惊见元玥满身伤痕，唯有求助王蓁。王蓁请求太平交还元玥，太平答应，却见元玥身患恶疾……王蓁攀树时不慎失足，得三恕及时赶至抱住，却因而勾起二人的往事。三恕奉命护送王蓁回乡修坟，路上遭山贼袭击，三恕带王蓁逃至破庙。三恕照料发高热的王蓁时，竟对王蓁情难自禁……隆基与何离赶至营救。众人在别苑安顿之际，竟有刺客杀出……

三恕指刺客对他们的行踪瞭如指掌，疑有宫中的人在幕后策划此事。隆基、王蓁平安回到宫中，太平在众人面前表示会全力协助寻凶。元玥向王蓁细说儿时与姊姊的故事，王蓁希望她的善良与坚持可以一直保存下去。元玥想念姐姐殷瑈，还有当日她在山路上偶遇的「萤火虫哥哥」。若芊相约元玥偷看龙武军训练，被何离发现；元玥与何离针锋相对，其后意外拾获一面平安竹牌。太平被王蓁触怒，向李旦诉冤说屈之际，隆基求见并指控太平重伤王蓁……

太平奏请离宫，李旦竟然准奏。太平深信秦槐只要将一幅画交给圣上，李旦便会收回成命……元玥到太医署取药时遇上狱长，从他们口中得知自己曾多番获何离襄助。元玥拉若芊到御花园看萤火虫，期间发现女史慧菊的尸体。司制、司珍两房大打出手，琼香责备碧云、相思管教不力，惩罚她们反省思过。若芊、元玥欲分别协助三恕及何离查案，结果却弄出不少笑话。相思在御花园遭神秘人袭击，危急关头碧云出手相救，却令自己身陷险境！

何离向碧云、相思询问遇袭经过，二人非常合作，互补不足。众女史猜测凶案因由时，女史丁兰推说事件跟宫中风水有关。芳媚提醒王蓁要为大唐负上繁衍龙嗣责任。王蓁到尚宫局安抚人心，此时女史丁兰竟突然失常。四司为如何处置丁兰互相推卸，王蓁察觉个中玄机，找出真相。隆基离宫期间，王蓁身体不适，诊症后证实怀有身孕，然王蓁竟要求太医保密此事。何离护送元玥回宫，途中元玥发现何离的言行举止，竟与回忆中的情景不谋而合……

元玥提供案件关键线索，助何离、三恕锁定凶徒。凶徒向王蓁下手，元玥奋身保护，终击倒凶徒。元玥确认何离是当年的「萤火虫哥哥」，并将竹牌物归原主，二人感情更上一层楼。李旦一直为成器与隆基生母遭武皇赐死而愧疚，决定追封二妃为后。隆基、成器亦赶回宫中，出席追封大典，此时太平竟一身素服出现。太平在宴席上提及王蓁与三恕曾共度一夜，王蓁担心此时公开怀孕一事，会令隆基的名声备受打击。元玥略施小计，为王蓁舒困解忧……

隆基知悉王蓁怀孕，高兴地与何离、三恕分享喜悦，未料当夜王蓁竟发生意外。隆基心情尚未平复，却在此时，得知另一噩耗……三恕决定对一直向自己献殷勤的若芊好言相劝。何离查到殷瑈的线索，元玥感激不已，二人彼此更添好感。太平以斋戒为由留在宫中，隆基与成器联手，设下「蟠龙宴」为太平饯行。宴席上，太平与隆基等人唇枪舌剑时，竟突然吐血昏厥。李旦得悉太平出事，愤慨不已，将调查重任交托予成器，又怒指隆基有下毒动机……

隆基被怀疑毒害太平，王蓁决心为隆基查明真相。尚宫局各人因负责筹备「蟠龙宴」而人人自危；王蓁与三恕直指司设房与司膳房嫌疑最大，要即时收押琹与汪敏，琼香身为尚宫局之首亦难幸免。王蓁查到一种罕有奇药，怀疑乃太平所中之毒，何离、三恕查出曾有人在「蟠龙宴」前领取此药。二人拿下嫌疑人并展开审问，芳媚突然出现包庇此人。芳媚终向李旦道出原委。元玥联想到太平中毒的内情，王蓁得悉后，决定在殿上重演「蟠龙宴」情况……

王蓁以身作证，成功揪出真凶为隆基平反。元玥因多次试毒，体虚乏力；若芊探望被元玥看穿心事。若芊相信能对三恕精诚所至，又以习武为名，藉此进一步亲近三恕。太平为表自己不再恋栈朝堂，决定将封地财产悉数交出。何离查出当日押走殷瑈的陈内侍下落，元玥随同何离出宫拜访。途中，元玥为抢回被贼人偷走的木盒，奋不顾身……何离、元玥抵达陈内侍居所，惊悉陈内侍已离世。二人茫然若失，时一名陈内侍故友出现，表示知道殷瑈去向……

元玥因为殷瑈的事情沮丧，何离亲切关怀，让元玥重新振作。民间流传影射皇权更迭的童谣，太平更向李旦指出与近日天象不谋而合，暗示隆基有弑君夺位的野心。隆基面见李旦，李旦竟表示要传位予隆基！太平闻此消息震惊不已，派人到尚宫局替自己准备寿衣……隆基登基为帝，王蓁亦册封为后。然大典上李旦的圣谕，出乎隆基所料。太平向隆基道贺，期间故意提及王蓁不育一事。太平的外甥女郑纯熙出现隆基面前，指自己是隆基即将册立的妃嫔。

纯熙乖巧可人，深得李旦等人欢心，且对隆基一往情深。太平在册封纯熙的位号上咄咄逼人，隆基为大局着想只能哑忍。元玥本对纯熙不抱好感，却因一事而有所改观。王蓁与尚宫局筹备纯熙的册封事宜，太平却诸多留难。纯熙洞悉元玥心事，直言宫中不容男女私情。纯熙册封当日，王蓁前来祝福，竟弄坏了太平赠予纯熙的「榴开百子」步摇，纯熙激动。隆基察觉王蓁受伤，对纯熙恨意更深……三恕完成任务回宫，与纯熙相遇，发现彼此竟是旧相识。

纯熙一直遭隆基冷待，心里难受。元玥劝勉纯熙改善脾气，纯熙大惑不解……纯熙为芳媚和雨嫣奉上点心，岂料纯熙的侍婢水仙竟突袭芳媚。元玥与纯熙挺身保护芳媚，却遭水仙反攻，刀尖更直刺向元玥……王蓁就芳媚遇袭问罪纯熙，下令封宫；太平反指王蓁欲加之罪。事件交由李旦裁决，此时有人求见，表示能为纯熙的清白作证……元玥向王蓁直言对纯熙的看法，王蓁听后若有所思。雨嫣希望有人能为李旦分忧，王蓁便提议收元玥为李旦义女……

阿史那王子即将入使大唐，王蓁吩咐元玥准备见面礼，元玥为此苦恼，幸得纯熙协助解决。隆基对纯熙仍有戒心，元玥乘势为二人制造独处机会。元玥偶然发现殷瑈的记号，终寻获殷瑈昔日留于宫中之物。元玥惊悉自己要和亲番邦，难以置信，恳请王蓁求李旦收回成命，王蓁拒绝。何离与三恕一同恳求隆基，唯隆基明言此事关乎国体，爱莫能助……隆基探问王蓁举荐元玥的原因，王蓁的回应令隆基意外。隆基看见纯熙为元玥诚心祈求，不由心动……

龙武军上下一心，协助何离化解元玥的和亲危机。众人欲上演一场击退刺客、营救阿史那的戏码，岂料阿史那竟遇上真刺客……何离、三恕惊悉阿史那来唐的内情，及后向他交出隆基的锦囊，阿史那阅毕后决定立即回程，并搁置和亲。四司为白忙一趟而沮丧，此时汪敏头痛大作。太平收到密报，指隆基勾结番邦，并当众展示阿史那给隆基的密函……隆基确信纯熙是太平安排的线眼，纯熙百口莫辩。女史们私藏何离画像，琼香看到画中人后震撼不已。

琼香为调查何离身世，特意拜访龙武军。三恕不忍纯熙被隆基冷落，欲为纯熙美言。王蓁召见三恕，与三恕提起往事，三恕明白王蓁用意。王蓁向尚宫局上下宣布「放阴」，让年迈体弱的宫人还乡，汪敏以为自己必在「放阴」之列，岂料事与愿违。元玥得知汪敏渴望离宫原因，遂请求王蓁帮忙。汪敏终获恩恤离宫，决定离开前报答元玥帮忙，又向下属表达谢意。此时汪敏的兄嫂入宫，竟力劝汪敏留下，汪敏恍然自己多年来一直活在谎言之中……

汪敏决定留在宫中，惟「放阴」一事已成定局，纯熙遂请太平帮忙。若芊鼓起勇气，往找三恕表白……雨嫣向王蓁提及皇嗣之事，劝王蓁放下私心，接受纯熙。太平带同女子画像揶揄王蓁，令她难堪。王蓁决定向纯熙示好，又劝隆基雨露均霑。纯熙为学习妇德，到藏书阁阅读抄写，未料伏案昏睡期间，藏书阁竟然失火。何离、三恕与龙武军奋勇扑火，若芊迟迟未见三恕，担心从此与三恕阴阳相隔……纯熙死里逃生，王蓁竟向太平承担罪责，隆基错愕。

纯熙受伤，王蓁一力承担责任……龙武军调查后，认为是有人蓄意纵火，置纯熙于死地。何离、三恕发现藏书阁薰香有异，对负责换香的南宫琹展开审讯，并怀疑纵火案与王蓁有关。太平对纵火案紧咬不放，逼使隆基务必交出真凶。何离、三恕率众逮捕纵火犯人之际，成恭突然出现并自称真凶。元玥到牢房探望成恭，恍然明白成恭的用心。成恭将被发配边疆，临别前成恭对三恕的一席话，令三恕醍醐灌顶。琼香继续调查何离身世，终得到明确答案……

成恭被问罪流放，南宫琹自觉愧对成恭。成恭临行前一直期待南宫琹前来送行，出现的人却是元玥……碧云、相思、最近入宫的太医文可谦重遇聚旧，碧云、相思皆对可谦留有好感。何离偶遇拜祭肃明皇后的琼香，琼香对何离作一番寄语。若芊在元玥、纯熙鼓励下，再次往找三恕，却与三恕无言以对。何离推波助澜，三恕终有机会对若芊剖白心迹。元玥希望隆基能多加关心纯熙；隆基邀纯熙月下抚琴，纯熙大喜，但原来隆基此举另有目的……

纯熙终得悉自己一直被太平利用，怒然质问太平。太平正要教训纯熙之际，隆基挺身相护，纯熙感动不已。隆基有要事离宫，婉言劝王蓁与纯熙要友好相处。纯熙到紫兰汤药浴调理身体时，惊闻刺客出现，三恕途经并冲入紫兰汤救人。王蓁与雨嫣游园至此，遇见三恕、纯熙共处一室，以为二人暗结私情；三恕、纯熙百口莫辩。何离须于三日内找出关键的宫婢为三恕作证；隆基赶及回宫并提出延后审理事件。太平竟出现阻拦，此时元玥将若芊带到殿上。

若芊承认使计诬陷三恕与纯熙苟且，终被判杖刑。三恕痛斥元玥以若芊作代罪羔羊，元玥向三恕转述若芊的苦心。太平不忿错失铲除三恕的良机，此时得知肃明皇后遗孤可能尚在人间，认为其嫡子身分，必能动摇隆基帝位。若芊得知昏迷期间，三恕守护在侧，大为感动。元玥、纯熙与若芊经此一役，感情更笃。王蓁为再度成孕用尽方法，此时纯熙传出怀有龙裔，隆基兴奋不已。王蓁表现大方，为纯熙打点一切；唯眼见纯熙备受恩宠，不禁五味杂陈……

王蓁遇见三恕，三恕藉紫兰汤一事相劝王蓁。王蓁对纯熙关怀备至，更表示会协助照顾纯熙孩儿。可谦分别与碧云、相思谈及往事，二人感窝心。芳媚心烦气躁，向王蓁及太平出气。未几，芳媚突然薨逝，隆基建议剖尸检验查探内情，王蓁、太平均强烈反对……三恕、何离意外发现药库的千山灵芝失窃，相思偶然得知窃贼竟是可谦，可谦向相思道出原委，相思闻言动容。龙武军在碧云房间搜获千山灵芝，审问期间，相思指证乃碧云盗窃，众人诧异……

碧云不忿被相思出卖，反指相思与可谦淫乱后宫。碧云、相思与可谦一同被收押。碧云、相思在牢房继续互相指斥，可谦忍无可忍怒骂二人。龙武军终查出真相，可谦得到应有下场。可谦助手茗风求王蓁拯救恩师，王蓁答应。王蓁为隆基打点纯熙孩儿之事，隆基心中感慨。李旦自芳媚离世后，变得暴躁易怒，雨嫣处处体谅。隆基和雨嫣聊起旧事，隆基敬重雨嫣慈祥可亲，得知雨嫣手患红疹，更表现关心。隆基继续调查芳媚的死因，竟有意外发现……

太平、隆基分别查出芳媚之死跟雨嫣有关，雨嫣终将事情始末和盘托出。李旦亲自审问雨嫣，雨嫣的回应令李旦痛心。李旦决定待纯熙诞下孩子后，便交出所有皇权。隆基满怀期盼，积极为孩儿取名。王蓁眼见隆基对纯熙日趋体贴，感到茫然若失。宫中流传摸过「金鹊来朝树」上的喜鹊蛋，就会一索得男，纯熙得知后跃跃欲试。元玥劝阻不果，唯有为纯熙代劳。元玥爬梯时发生意外，伤及纯熙！隆基惊闻噩耗，震撼痛心，元玥带同宝剑向隆基请罪……

元玥悔恨自己伤害了纯熙，在寺庙绝食忏悔；若芊与纯熙前去制止。隆基发现太平翻查肃明皇后旧事，确定她正查探遗孤下落，命何离严加留意。琼香得悉何离打听肃明遗孤之事，暗自担心。若芊生辰将至，向三恕有所暗示。三恕竟无动于衷，若芊大为气结。夜静，三恕与何离及龙武军众人开会商议，众人神情凝重……元玥提前送出生辰礼物，若芊觉元玥有事隐瞒，再三追问下终得知个中秘密。若芊到御花园采花，偶然得悉一场后宫阴谋……

若芊被发现头部重创，昏厥不醒；何离查悉若芊受伤并非意外。太平找到当日怀疑送走肃明遗孤的大师真严下落，打算将真严带回宫中问话。纯熙发现茗风的唱戏才能，表示有意举荐。茗风信以为真，惊悉当中有诈之际，已欲辩无从，只得将过往恶行和盘托出。纯熙押着茗风往找王蓁对质，王蓁反指纯熙诬蔑；纯熙对王蓁深恶痛绝。太平向真严质问肃明遗孤之事，真严却一直避而不谈；惟何离从中得悉肃明遗孤的相关线索，不禁对自己的身世起疑……

琼香终向何离道出隐藏多年秘密，何离闻言不禁百感交集。纯熙绝食明志，隆基担心探望，纯熙请求隆基将自己废黜……隆基发现三恕隐瞒肃明遗孤的身分，对三恕以剑相向。太平召见何离，指出隆基种种不是，望他藉肃明遗孤嫡出地位，将隆基推下龙座。隆基得悉太平欲拉拢何离，要何离作出选择。纯熙遭隆基冷待，心如死灰。元玥疼惜慰解，陪纯熙饮茶夜话。翌日，纯熙携酒往找王蓁，向王蓁释出善意。王蓁亦接受纯熙道歉，并与纯熙对饮……

三恕请求隆基，在大局既定后，能够圆自己心愿。王蓁发现汪敏似乎知道殷瑈事件的来龙去脉；隆基请汪敏将真相告知元玥，元玥知悉太平曾向殷瑈滥用私刑，愤然斥骂太平。太平一怒之下，拔剑直指元玥……太平蓄势待发，密谋逼宫。三恕告知何离，隆基打算将他置于死地。何离决定投诚太平，元玥矢志共同进退。太平试探何离虚实，暗里却有所盘算。太平终展开谋反大计，大殿之上，直斥隆基对大唐龙裔狠下毒手，废天子、保江山势在必行……

（大结局）大殿之上，隆基与太平剑拔弩张之时，王蓁携太平谋反罪证赶至，局面逆转。大局既定，隆基为三恕完成心愿，质问王蓁所作所为，王蓁不畏不惧，最后隆基如王蓁所愿，信守当年承诺。李旦召见何离，探问肃明遗孤之事……琼香与四司获恩准，可以选择去留。太平再会隆基，半生荣宠已成过往，等待她的是一阙哀歌。众人各如其意，各有所安，有人欢喜满足，有人悲伤自怜；有人团圆相聚，有人无奈别离；有人傲踞顶峰，有人甘于平淡。