吴妍珠为寻找失踪的父亲吴成务而来到工作室，却突然被拖拽到了一个陌生的地方。妍珠在这个地方发现了流着血、濒临死亡的姜哲，并救了他的性命，而姜哲在医院醒来后，便开始寻找救了自己便消失不见的妍珠。

吴成务回来了的消息一下子从工作室传到了吴妍珠那里，对于自己亲身经历的那件事，妍珠想侧面向父亲确认，但父亲却显得非常敏锐，妍珠一无所获，什么也没问到。另一边，吴成务为再次置姜哲于死地，而开始画画。妍珠想起了姜哲注视自己的眼神，感觉很难受，这时，奇怪的景象在眼前出现了。

秀峰开始相信妍珠的话，并表示可以进入漫画应该是有规则的，而此时妍珠却突然失去意识而再次被召唤进了漫画。姜哲把回来的妍珠带到顶层豪华公寓，问了之前没问完的问题，却没有听到他想要的答案。 

姜哲遇见了贤锡，并告诉贤锡妍珠是揭开自己人生秘密的唯一存在。另一方面，妍珠因为昭熙而被警察抓住，姜哲为了救出被关在拘留所的妍珠，让妍珠诚实回答自己的问题。

姜哲为了去见妍珠而前往明世医院，却因为在漫画《W》的广告中见到了“自己”而先去了书店。看完漫画后，姜哲确定了自己在现实世界里的存在，他向妍珠做了最后的道别，决定去制作一个与整部作品脉络吻合的结局。

虽然妍珠急急忙忙的赶往成务的工作室，但是成务已经被姜哲的枪射中躺在了地上。姜哲在给妍珠寄出了最后一封信后，为了创造出符合脉络的结局去往了汉江大桥。

姜哲像什么事都没有一般从睡梦中醒过来了，妍珠在姜哲的世界里被当成逃犯而再次被捕。妍珠给姜哲设定了新的目标，开始了只属于他们两人的续篇。姜哲虽然下定决心放弃寻找真凶，但真凶却找上了妍珠。

成务在飞机上受到无面真凶的袭击后，立即回国。在妍珠口袋里找到了姜哲留给自己的U盘，准备重新改写漫画结局。又再次被网漫世界召唤的妍珠，伤心地看着无法认出自己的姜哲。成务为了有脉络的结局，将姜哲可以接受的人物设定为真凶——即成务本人。妍珠与她思念的姜哲再次见面了。在姜哲的世界，直播寻找真凶的时候发生枪击袭击，多人死伤。而凶手正是有着成务的脸。原来真正的幽灵凶手夺走了现实中成务的脸，并且拥有随时穿越两个世界的能力。

妍珠无法回到现实中，只能在医院里待着，姜哲很关心妍珠望向自己的视线。由于真凶的出现，哲浩陷入了危机，真凶给哲浩打了电话，并告诉他以后会发生的事情。另一方面，贤硕向姜哲询问10年前事件的真相。

回到现实的妍珠在工作室发现失去脸的成务，通过秀峰得知原来故事有所变化是因为是真凶所画。妍珠在冲击和害怕之下抢了成务的画板，为了救姜哲而画画。再次被召回到网漫中的妍珠出现在哲浩的会议室，发觉到自己还可以被主人公以外的人物所召唤。另一方面，见不到姜哲的妍珠去找了道允，在道允的帮助下与姜哲再次相见。

姜哲确认自己是网漫人物的瞬间，次元之门出现了，他和姜哲妍珠一起通过次元之门回到了现实世界。已掌握成务工作室里所有状况的姜哲通过画板和真凶进行了对话，真凶对姜哲说，虽然担心主人公的资格丧失，但是马上就会被消灭。一方面，想和妍珠约会的姜哲拜托妍珠画一幅画，利用确定的变数来召唤漫画里的自己。

看到吴妍珠这一角色再次登场的朴教授放弃了继续追《W》。漫画世界中在举办着姜哲的葬礼，而在现实世界中姜哲与妍珠约着会梦想着平凡的恋人生活。就这么在期待着《W》的“happy ending”的瞬间，再一次出现变数，真犯逃了出来并绑架了妍珠。

暂时恢复意识的吴妍珠再次失去意识心脏停止跳动。找回脸的成务回想起真凶的记忆寻找妍珠，透过姜哲知道了妍珠已经死掉的事实。另一方面，想救活妍珠的姜哲落入韩哲浩的圈套而被绑架，陷入死亡危机中。

知道姜哲消息的妍珠去寻找姜哲，在法庭上受到判决的姜哲看到妍珠还活着就安心了。另一方面，哲浩为了抓住逃跑的姜哲，绑架了道允，妍珠和姜哲为了逃出漫画想要结束最后一集。

妍珠希望能与姜哲以及父亲一起逃出漫画，三个人一起好好生活。姜哲为救道允而跟哲浩碰面，却被哲浩开枪打伤。身负重伤的姜哲希望能见妍珠最后一面，妍珠赶到时看到姜哲倒在了公交站前，漫画结束了。