小枫得知阿拓的父亲黑川真是最高检的王牌检察官，不禁对于阿拓为何要当薪水微薄的刑事案律师产生了疑问，但又不敢去问他本人。这时，他们又接到一件没有油水的法律援助委托。委托方是因便利店抢钱、打伤店员而被以强盗致伤罪逮捕的十胜岳雄。岳雄只有21岁，在小吃店打工。负责此案的刑警说，岳雄从十几岁起就多次盗窃，是个出了名的惯犯。在会见时，岳雄对阿拓和小枫的态度很恶劣。而且，他情绪激动地敲着桌子称自己什么也没做。阿拓注意到岳雄的手因为在小吃店当厨师所以有很多小的被刀切的伤口，但岳雄因为小枫怀疑他，一气之下把阿拓和小枫赶走并拒绝他们辩护。岳雄的母亲睦美担心儿子，她告诉阿拓和小枫，岳雄虽然在高中时代很荒唐，但是如今他为了成为厨师，正在洋食屋认真学习，绝对不会去抢劫。睦美重新委托阿拓为岳雄辩护。阿拓宣布要和检方决一死战。然而，他们看了电视台的聪子搜集的关于案件的情报后，发现案发现场的防盗录像上有岳雄，现场也留下了岳雄的指纹，所以很难为他脱罪。这时，别府所长把二人叫来，提议这次的辩护由小枫主导。他这么做是为了防止阿拓胡来，但是小枫却感到压力很大。第二天，为了能争取检方不起诉，阿拓、小枫和穗香来到案发的便利店，寻找能推翻岳雄有罪结论的证据。他们虽然发现警察杜撰了调查结果，但是附近的人都对单亲家庭长大的岳雄有偏见，认定他必然走上犯罪之路，这让小枫很生气。岳雄说他在案时正在附近的加油站。三人来到加油站，在防盗录像上发现了岳雄的身影，但时间比案发时稍早时间，所以不能作为不在场证据。阿拓向来进行现场取证的检察官指宿投诉警方调查不利。但是，指宿则用从阿拓父亲那里学到话来回应：怀疑他必然是因为他有可疑之处。争取不起诉的时间越来越紧迫了，小枫为找不到辩护的材料着急。但阿拓却执着于加油站对面房子庭院里巨大的物体。小枫忍不住批评他。在看守所中，因为连日接受审问，岳雄已精疲力尽。就在此时，受阿拓之邀分析监视录像的秋保有了新发现。

小枫听说阿拓在大学三年级时从理工学部转到了法学部。从那时开始认识了阿拓的汤布院说在决心成为律师前阿拓与现在的样子截然相反，但关于阿拓性格改变的原回，汤布院却含糊其辞。这时，聪子带着青岛医院的护士白山美纪来到事务所。青岛医院发生了手术中人工心脏骤停而导致患者死亡的医疗事故，主刀医生云仙被捕。美纪想请阿拓为云仙洗清冤枉。她暗恋耿直的云仙，所以觉得因院内告发而把罪过推给云仙一个人非常可疑。阿拓和小枫与云仙面谈，云仙曾多次要求直接向死者家属说明事情经过，但都被医院阻止了。云仙为自己没有挽救患者而自责，而阿拓劝说下，他为了向遗属说明真相决定接受辩护。很快，阿拓与小枫、穗香会见云仙的同期、已经升职的医生磐梯，在拿到医院交给遗属的内部调查报告后，开始进行现场调查。阿拓还想和参与手术的工作人员谈话，但是磐梯以急诊太多为由拒绝了他。阿拓带着内部调查报告去见云仙。云仙看完内容后惊愕不已。医院方面为了能以云仙个人失误了结此事，谎称是云仙的指示出错。云仙说人工心脏的电源没有任何预兆就停止运行了，根据他的话，阿拓开始探究电源没电的原因。然而，别府所长和登别律师却试图阻止他。因为保骏堂事务所是人工心脏的生产厂家顾问，如果暴露生产厂家的产品发生机械故障，那事务所也会受到重大损失。虽然明知得出对事务所不利的结论会被开除，阿拓仍发誓要彻底地追查真相。就在这时，检方确定要起诉云仙。尽管阿拓找到了参与手术的实习医生在法庭上作证，但开庭那天发生了意外情况。无计可施的阿拓意外地发现了线索，在秋保帮助下，他又开始进行大规模实验。

企业法务部门律师登别悄悄接受了他所爱慕的女性小笠原奈美的刑事案辨护委托，被事务所发觉了。阿拓和小枫紧急接手小笠原的案子。在食品玩具工厂上班的奈美因涉嫌在海外旅行时杀害同事姬岛理沙被捕。理沙是溺水而死，她的尸体的肺中有大量砂子，所以该案被认为是谋杀。而奈美完全否认检方的指控。聪子告诉阿拓和小枫，奈美的人气很高。阿拓和小枫到工厂打听情况，穗香从同事们的证言中发现奈美与理沙关系不错。这次调查没什么收获，阿拓和小枫又去了发生命案的海岛。在案发现场的海岸，阿拓突跳入寒冷的海水中，再现事件过程。回去的路上，小枫参加了阿拓老家的宴会。因为阿拓与精英检察官父亲不和，所以黑川家气氛相当差。虽然这对父子围坐在餐桌前，但仍能看出他们之间的争执分歧。就这样，在缺乏有力的辩护材料的状况下，他们迎来了初审之日。作为检方证人出庭的奈美上司鹤见的证言令人意外，阿拓等人处境更加艰难。阿拓决定追查被奈美隐瞒起来的复杂的人际关系。就在这时，科学家秋保来到事务所。

某名牌高中击剑部的顾问高松洋介委托阿拓和小枫为他辩护。高松在指导社团时，用剑击中了王牌选手藤里，后者因为脉律不齐而心跳停止，高松被起诉过失伤害，目前取保候审。藤里捡回了一条命，现在正在家里疗养。高松说事发时自己击剑不足以造成那样严重的伤害。为了调查，阿拓和小枫、穗香到了藤里家，但被藤里的母亲拒之门外，只好去学校调查。校长和社团学生们都说高松是个优秀的教练，平时也没见高松与藤里有矛盾。社团成员田代表示自己愿意为高松出庭作证。阿拓看了聪子拿来的记录着事故发生时的练习情况的视频，但是最重要的事故发生的那一瞬间却因为混入杂音而看不清楚。这时，小枫过去所在的大牌律师事务所内发生的性骚扰丑闻被曝光。被周刊要求采访的小枫回忆起过去被侵害的辛酸往事，非常苦恼。就这样，高松的案子迎来了辩护方询问证人的日子。站在证人席上的田代的发言让法庭一片哗然。但是，在秋保协助下进行科学调查的阿拓发现了谁也预料不到的真相。

小枫得知秋保在东央大学上学的妹妹被杀，秋保妹妹的交往对象、同大学的理工学部学生被判有罪后自杀。负责为被告辩护的是汤布院的搭档、别府的兄长。而当年负起诉的检察官是阿拓的父亲。这样复杂的情况让小枫混乱。穗香又告诉她，与案件有关的人士至今仍认为此案有可能是冤案，不过，阿拓之所以执着于洗清冤案却另有原因。这时，阿拓和小枫接到新案子。当事人是与事务所签有顾问合同的樽前物产的社长之子樽前裕也。裕也涉嫌枪杀朋友新岛彰，他否认指控，但目前的状况证据对他非常不利，而周围人对的他的评价也很差。阿拓等人拜访樽前家，听住在这里的管家有珠田说，案发当天，他听到裕也在房间里弹乐器。自称是音乐家的裕也每天都弹乐器，因为音量太大而被邻居投诉，然而，阿拓却找不到在案发那天听到乐器声音的邻居。与此同时，被害人新岛的母亲直接到律师事务所，要求他们不要给樽前辩护。裕也的不在场证明无法确定，而正在这个时候，穗香的儿子晴斗被绑架了，她收到威胁信，信里说如果她不放弃为裕也辩护就杀了她的儿子。阿拓凭直觉认为是新岛的母亲绑架了晴斗，但他发现了意料之外的事实，事态发展急转直下。

小枫得知，杀害秋保的妹妹的浅间是阿拓的发小儿，阿拓相信浅间是被冤枉的，而秋保作为被害人家属，怀着复杂的感情帮助着阿拓。这时，阿拓、小枫代替汤布院担任满里奈的辩护人。满里奈是富商乘鞍权三郎的年轻妻子，被怀疑杀害了权三郎。权三郎是因一氧化碳中毒而死，满里奈说他俩是烧炭殉情，她自己也因中毒而被送进医院。不过，检察官方面怀疑她事先买了煤炭意图杀人。乘鞍家的防盗录像显示，满里奈在充满一氧化碳的房间里呆了一个多小时。第二天，阿拓、小枫、穗香来到乘鞍家。权三郎前妻所生之子阿肇说满里奈一定是从窗户逃出了充满一氧化碳的房间，等权三郎死后又回到房间。而阿拓注意到一丝异样。公审当天，检察官方面根据年轻目击者的证言，主张满里奈在案发时从窗户离开了房间，阿拓这一方则以院子中的传感灯没有反应为依据反驳检方的说法。眼看他们就要胜诉时，阿拓的父亲对他说“以想知道真相为动机进行辩护活动是不行的”。实际上，阿拓也怀疑满里奈是杀人犯，如果追究真相也许会揭穿委托人的谎言，作为律师，他非常苦恼。但是，小枫的一句话让他下决心进行实验验证。

聪子请阿拓与小枫为式根大充洗清冤罪。24年前，式根因伊东电机宿舍杀人案而被判死刑，在监狱中生活了很多年。当年，式根所住的公司宿舍举办圣诞派对，现场的果汁里被人投毒，导致六人死亡。虽然没有直接证据，但持有毒药的式根被屈打成招，他的自白成为决定性证据，最终被判死刑。聪子与式根长年保持书信往来，得知是警察捏造证据。现在，式根身患癌症时日无多，聪子不希望他含恨而终。但是，“再审”被人称为“打不开的门”。一直为式根辩护的盐原律师生前曾四次提出再审申请，均被驳回。在阿拓、小枫与式根会面时，他本人说不希望申请再审。式根的妻子已死于那次事件，审判也无望，他说怀着希望而不能实现太痛苦了。别府所长也叮嘱阿拓说再审与以往的辩护不同，让阿拓适可而止。阿拓、小枫、穗香依靠盐原律师留下的大量资料调查案件，他们注意到当时在电机厂工作的人都有机会拿到毒药，而且式根坦白前后案件相关人士的目击证言变化很大。但当他们与改变证言的证人会面时，大家都三缄其口。阿拓推测，是让案件快点结束的心理影响了这些证人的证言。阿拓他们又拜访了式根的独生女玲子。案件发生以来，玲子饱受媒体骚扰和世人冷遇，所以不想再与式根发生联系。深切感到作为媒体人的罪恶感和无力感的聪子回想起在制作追查东央大学学生杀人案的节目时，秋保对她说“谈论证据不足可能是冤罪，是在践踏被害人遗属的感情”，意识到可能就是因为这个原因，秋保至今都对她很冷谈。

再审请求被驳回后，眼看对过去的案件进行再调查困难重重，阿拓非常郁闷。汤布院告诉小枫，11年前，阿拓的发小儿浅间大辅被指控杀害秋保的妹妹，后来浅间在狱中自杀，为替好友洗冤，阿拓至到现在仍正在考虑推动“死后再审”。这时，关于东京都内发生的美大学生遇害案，聪子送来了十分值得注意的情报。据说受害人脖子上的伤口与11年前的案件一样呈现独特的“勾玉”形状。被害人花卷京香以前就报警称遇到了跟踪狂，警察逮捕了在附近工厂工作的富士田顺平。阿拓、小枫马上去探视富士田。富士田承认曾偷拍，但否认杀人。警方在他工作的地方发现了带有京香血迹的证据，对此，富士田称根本不记得有这东西。阿拓怀疑11年前的案子与富士田有关，但因为没有调查就没有发言权，所以他决定当富士田的辩护人。富士田在案发前于社交网络上传了夕阳的照片，阿拓、小枫、穗香来到拍摄照片的河边。因为犯人就是把尸体扔在那里，所以检方断定富士田拍照是在寻找实施犯罪的地点。然而，阿拓觉得犯人特意把奇怪的内容发布到社交媒体上很不合常理。他记得11年前的案件也是如此，因为废墟迷浅间事前去过后来成为杀人现场的废墟，检方就断定他是在预先检查施暴地点。阿拓说想一个人思考，小枫和穗香先回了事务所。回去后，她们发现阿拓的母亲黑川丽来参观儿子的工作环境。她喋喋不休，别府等人疲于应付，就让小枫来接待她。黑川丽告诉小枫，其实，担任11年前案件主检官的黑川真比任何人都更关心阿拓。她请求小枫在阿拓辛苦的时候支持他。这时，黑川真询问秋保是否愿意到检察厅直辖的科学搜查机构任要职。虽然秋保一直在帮助阿拓进行冤罪辩护，但黑川真问他，作为受害人家属，是否真是与一心为蒙冤而死的朋友而遗憾的阿拓一样怀疑警方和检方的调查。听到此言，秋保的心动摇了。这天晚上，阿拓被“相信浅间无罪”与“是否无罪，不经调查就不清楚”两种相反的想法所困扰。小枫见状，鼓励他像一直以来为委托人辩护的做法去估就好。富士田如果是被冤枉的，那真凶就另有其人，那人如果就是11年前案件的真凶，那浅间的冤罪也可以洗清。听了她的话，阿拓深受感动。然而就在此时，芡城县山中发现了新尸体，因为凶器的形状与死者脖子的伤口与前案相似，所以富士田再度被捕。根据尸体的状况，警方判断死者、离家出走的少女山代奈奈是死于京香之前。而在警方推定的被害时间，富士田正好回老家茨城探亲。于是，检方追加起诉仍否认杀人的富士田。

小枫为保护阿拓被蒙面男子刺伤。凶手逃走，而来医院调查案件的刑警对向来不信任警方的阿拓冷嘲热讽，别府也批评阿拓。阿拓为小枫的受伤而深深自责。另一方面，聪子发现被害人京香与疑犯的富士田在社交媒体上有一个共同的朋友，名叫“KooZ”。而在11年前被杀的彩花与自杀的浅间的博客上也有一个叫“KooZ”的人留言。这个“KooZ”的社交媒体的首页图片上有与被害者脖子上的伤相同形状的“勾玉”。秋保注意到，勾玉的形状和英语中接在名词后面表示所有物的单词很相似，他推测犯人是在宣告“被害人是自己的所有物”。富士田告诉阿拓那个“KooZ”在网络上加自己为好友，但他们并没有见过面。这时，一个叫神津一成的男子突然自首，说自己刺伤了小枫。神津的律师道到保骏堂事务所要求和解，说犯人是冲动犯罪而且已经深刻反省。但阿拓注意到神津是京香就读的大学的学生科职员。而且，神津的姓氏发音与“KooZ”相似。阿拓觉得这些都不是偶然，便提出与神津会面。在会面时，神津有意无意地表露出自己与11年前的案件有关，让阿拓高度紧张。神津说起自己曾在东央大学学生科工作，又趁监视会面的警官离席的间隙，小声对阿拓说这次的两个案子和11年前的案子的受害者都是自己杀的。因为没有证据，就算真凶近在眼前，阿拓仍无能力为。他与汤布院一起走访11年前负责查案的刑警草津，得知在案发现场的遗留物中有吸过的烟蒂。浅间是不吸烟的，但当时这件证物没有被检方采用。阿拓向检察院提出公开证物和再审要求。经过聪子全力奔走，媒体把矛头指向过去案件的真相，东京地检却找借口查封了保骏堂事务所。与此同时，再审请求被驳回，所谓烟蒂也不在证物中。阿拓感到检方一连串的行为背后是父亲黑川真在捣鬼。他回到家，痛斥检察院为保住面子而隐瞒真相。对于他的指责，黑川真回答说自己根本不知道现场遗留物中有烟蒂这样的证据。阿拓非常气愤，而小枫却从黑川真的回答中看到了希望。他们回到因为被查封、所有的资料都被检方拿走而处于关门状态中的事务所，发现同事们都在等他们。一直反对阿拓调查冤案的别府说不能屈服于检方的横暴，支持阿拓洗清冤案。虽说别府讨厌刑事案，但是由于兄长因11年前的案件郁郁而终，他也想替兄长弥补遗憾。以别府为首，事务所上下一心，为洗清冤案而奋斗。就在他们为寻找证据而奔走时，阿拓和小枫根据黑川真的回答中透露出的信息，确认遗留物中的烟蒂没有在检察院，而应该是由警方保管，所以前往警察署。