混沌的朝鲜时代，光海君因过份聪颖有才而成为今上宣祖的眼中钉，宣祖欲以光海庶出王子的身分迟迟得不到明国册封作为借口废黜光海，朝廷众臣便争相拥戴各自的势力，令王宫内外动荡不安，此时，与一具不明生尸一同出现的凶书使得朝政陷入一触即发的紧张局面。

病情加重的宣祖终于不治驾崩，朝廷众臣开始对世子光海君是否真能够坐上龙位一事议论不休，一日，临海君以企图谋反之罪名被带到光海面前，光海为临海君是否含冤一事烦心不已，正当此时，带着册封书来访朝鲜的明国使臣团指名要先见宣祖的长子临海君一面。

光海坐上龙椅后，同母亲兄弟临海遭遇不明不白之死，随着永昌年岁渐长，仁穆大妃愈发担心他的安危，宫中的紧张气氛一触即发，但一派天真的贞明和永昌却在正月十五日瞒着所有人偷溜出宫，而大君和公主失踪一事在宫中引起轩然大波，西人众臣甚至登入大殿。

仁穆大妃为保全永昌大君的性命而急于促进贞明公主的婚事，国巫垂怜盖在看柱元、仁佑和贞明的八字时发现贞明身上有股奇怪的不祥之气，光海派与西人的斗争越演越烈，光海亦决意与反对交河迁都的朝廷众臣发动正面冲突，并质问德馨究竟要站在哪一边。

李德馨等众臣在大殿前哭诉以逆谋罪名被逐出宫的永昌大君是冤枉的，但光海最终却将这一干人全部削官夺职，李德馨与洪霙隐藏多年的格庵南师古预言重现，宫中再一次掀起巨大波澜，龙椅之上挂着羊尸血染大殿，伴随着一张当今圣上并非王座主人的书信。

金介屎对光海说贞明公主将会威胁他的王座，谏言必须除之而后快，崔尚宫等人在逃亡途中牺牲，惟贞明一人坐上小船漂流出去，听见贞明和永昌死讯的光海气愤难抑，介屎只说那是一条不得已的称王之路，汉阴在无意间得知先王升遐的秘密，感到震惊不已。

对火器都监制造火药一事十分关心的光海，在听闻硫磺仓库空乏的消息后，便悄悄命校理洪柱元前往倭国去执行硫磺走私交易，抵达江户的柱元开始寻访独占硫磺的生意人安达，而贞明在得知朝鲜通信使将来的消息后便抱着回朝鲜的希望来到了江户。

贞明为了再次回到朝鲜，自告奋勇要帮助柱元与安达碰面，然而在江户凡走私硫磺被抓就免不了一死，二人便尽可能隐密地进行这笔交易，不料还是走漏了风声，在交易当下被官衙逮个正着，正当危急之中，贞明自愿扛下所有罪行并要柱元一定要活着回来救她。

柱元得知光海把自己当成诱饵的事后，虽然深感愤怒，但为了将硫磺与火儿带回朝鲜，决定再一次放手一搏。光海誓言一定要查出反对火药开发的背后势力到底是谁，便命令许筠悄悄接近道河，仁佑来到柱元家遇见扮成男装的贞明，便误会柱元离家出走是为了金屋藏娇。

柱元得知火儿是女子的事实后惊讶万分，火儿在东窗事发后反而更大喇喇地对待行事拘紧的柱元，正在火儿为进入硫磺厅工作而展现硫磺烧取法的同时，光海带着朝廷众臣来到火器都监，向众臣展示朝鲜已踏出独立开发火药的第一步，火儿更在因缘际会下与光海面对面。

贞明被误会是偷闯入火器都监的可疑之人而遭军兵逮捕，在意外之下与光海面对面，后在柱元以身担保之下终得以进入火器都监担任匠人。微服出巡的光海来访周愃府邸，二人在表面和平的相互试探间各怀鬼胎地暗自盘算着，火器都监发生莫大意外，贞明成了众矢之的。

朝廷众臣都认定火器都监事故的背后是光海指使，光海来找柱元表明自己不会救他，柱元孤注一掷将火儿放出来，请求火儿一定要查明事件的真相，求助无门的火儿只能找仁佑帮忙，并与荣富等人合力调查事件的来龙去脉，而光海对柱元的推鞫眼看就要开始。

柱元为了守住火器都监而要求光海赐他一死，光海无可奈何只好问柱元大逆之罪，贞明为保护柱元而说出光海早已知道自己的存在，并在柱元的责难中再次承诺会保住光海与火器都监，火器都监事故平安落幕，光海心里对匠人火儿很是介怀，便命金介屎去将火儿带进宫。

周愃与许筠设法要找出光海的弱点，许筠便将算盘打到仁穆身上，而仁穆则开始对贞明公主的生死抱持怀疑，光海带同柱元一起去见后金的秘使，并扬言一定会在这场战争中得到胜利，贞明得知洪霙在调查去过庆运宫的人，仓惶逃跑之际却被许筠的人掳走。

明国使臣团为了向拒绝派兵要求的光海下马威而先行前往庆运宫向仁穆大妃问安，得知此事的光海愤怒难抑，贞明对许筠说明自己的目的也是要将光海拉下王座，并要求许筠设法让自己和大妃见面，仁佑在得知各方信息后便开始怀疑起火儿正是贞明公主。

许筠让仁穆大妃卷入了自己所捏造的逆谋事件，并怂恿周愃买通朝廷众臣与王族宗亲要求光海赐死大妃，目的是为了制造日后将光海赶下王座的名目。光海为查明逆谋事件的真相，而下令寻找火儿，柱元先一步找到火儿将其带往安全之处避难。

贞明为了营救面临斩首危机的仁穆大妃而主动去向光海表明身分，并言明自己是为了报复而来，光海派柱元护送贞明去见仁穆大妃，母女终于得以重逢。许筠等人策动王族和百官欲使光海赐死仁穆，却被光海识破了这诡计，许筠便派人去抓贞明好藉此掌握局势。

柱元代替贞明中了刺客的刀当场倒下，幸有慈劲及时相助而幸免于难，贞明为查出刺客的背后势力而与光海一同连手，再一次假意投靠许筠，许筠感受到光海的威胁便一不做二不休，决意将光海与火器都监一同毁灭，地雷炮开始引爆火药仓库之际，贞明从火海中走出来。

许筠企图把光海和火器都监一同毁灭的计谋最终仍宣告失败，而贞明为了守护火器都监而受伤，周愃为求自保而动用私兵将许筠拿下交给光海，却不知光海已得到周愃谋反的铁证。 仁穆夜间突然做了关于贞明的恶梦，这时贞明被声称是奉御医命令而来的人带进宫里。

柱元抓住企图杀害贞明的医官欲加以审问是受何人指使，光海却对此事的幕后主谋了然于胸，贞明问光海为何到如今还会陷入被杀的危机，光海便将南师古预言一事据实相告。 仁佑自动请命要护送贞明离开都城，而柱元却来传达光海与向众人公开贞明存在的旨意。

绫阳君在宫门前席蒿待罪主张派兵支持明国，令光海和朝政更加混乱，仁佑因贞明的心意不在自己而心痛不已，这时金介屎出现，声称可以帮他得到贞明。 柱元等人从安达那里得知若朝鲜不派兵支援，明国便会与朝鲜开战的情报，光海意欲隐瞒情报坚持到底。

绫阳君大闹宫门要求光海答应明国派兵一事，光海亲自前往宫门要求他停止这一场戏，在绫阳君的危言耸听和姜周愃暗中推波助澜下，百姓们群起暴动要求朝廷立即派兵，贞明手持火器都监全体自动请缨的上书，请求光海答应派兵，并扬言自己也要一同亲赴战场。

贞明决意以硫磺匠人的身分一同参与派兵，光海要柱元保证是否能够守护贞明，仁佑为得到贞明而去找金介屎并投靠父亲周愃，而正式与柱元对立。 光海找来姜弘立作派兵队伍的都元帅，并在暗中下达密旨，令姜弘立戒慎恐惧，绫阳君查出暗中支持自己的势力正是周愃，便主动登门拜访要求周愃把自己变成朝鲜王。

光海为了保全被派去参战的朝鲜军队而下达撤退的命令，并私下召见世子与李尔瞻，要他们防备即将来到的危难。 绫阳君总算盼到了周愃的手下前来，为即将称王一事感到高兴不已，朝鲜军在首场战役大胜，不料却因后续的埋伏而身陷险境，柱元将贞明托付给仁佑。

明国战败，为使火器都监所有人员平安逃离而死守阵地的柱元终究未能逃脱，后传来朝鲜军归降后金的消息。 绫阳君为仁穆大妃举办贺寿进馔仪，贞明却当众否定绫阳君的举动并质疑其动机，众臣再次对支持绫阳君一事摇摆不定，金介屎请求贞明与仁佑成亲以守护光海。

光海欲向后金俯首称臣的消息让众臣群起反抗，甚至将承文院重重包围欲拦阻国书送出，都城百姓们成群结队要砸毁火器都监，贞明在其中受伤令百姓们讶然。 周愃因仁佑的提议而开始与绫阳君保持距离，而金自点终于在此时露出真面目，主动前往与绫阳君攀谈。

周愃为了聚集西人众臣的力量而欲促成贞明公主与仁佑的婚事，而贞明为了守护光海而表明愿意成亲，光海在百般挣扎下再次召金介屎进宫，并向她吐露自己这回要做一次人的选择，柱元在慈劲的救援下终于回到都城，而同时绫阳君与金自点也在暗中图谋大事。

金自点对仁穆说贞明公主在自己手里，希望仁穆能表示支持，光海心知御座已是难保，却誓言无论如何都要保护贞明和都监人员到最后，便去找仁佑谈条件。柱元与仁佑协力去寻找贞明，柱元将贞明送往医官府中，并欲赶回宫里保卫光海。

绫阳君等反正群众一举占领了大殿，并称呼光海为废主并下令四处追捕，仁佑让光海与贞明柱元说完最后一席话，便拿下光海交与官兵，绫阳君登基后欲将火器都监所有人与光海一同铲除，但贞明却赌上自己的命誓死保住了火器都监，并暗自期许将继承光海的大志。

仁祖颁布取下火器都监牌匾更名为别造厅的御旨，并归属于训练都监仁佑所管，贞明终日向仁祖进言要眷顾百姓，并指出现今朝廷和官员的弊端，令仁祖恼怒不已，金自点便出面与贞明谈判，提议贞明先拥有属于自己的力量再来为百姓发声，贞明首肯。

继宣布名下官房田的耕民免税之后，贞明又按照宫中规矩来惩治如贞，令仁穆及其身边的人日益忧心，崔鸣吉在得知公主的作为后便暗中与柱元联络，希望能与公主见上一面，贞明的行为彻底惹恼了仁祖，如贞便悄悄向仁祖献计，使银雪与安山嫂被抓到了捕厅。

银雪和玉珠被捕盗大将李适抓住，并指控她们与公主合谋将诅咒君王之物带进了王宫，柱元与都监匠人们都誓言一定找到证据证明贞明的清白，而崔鸣吉也决意相助，仁佑劝柱元说服贞明向陛下求饶才是惟一的活路，然而柱元却扬言定会守护贞明的意志与性命。

贞明为了银雪和玉珠而做出伪供，承认诅咒事件是自己所做，奸计得逞的仁祖露出微笑并要求贞明在自己面前跪地求饶，柱元在暗中派别造厅的匠人们搜集证据，仁佑担心贞明的安危，便对此事睁一只眼闭一只眼，柱元与崔鸣吉等人终于在最后关头扭转局势。

柱元前来向仁穆大妃提出与贞明的婚事，仁穆欣然同意，而这门婚事也在朝廷引起了不小的波澜，仁祖在与贞明长谈后开始犹豫是否该舍弃金自点与如贞而投向公主阵营，金自点发现不对劲，再次开始盘算，大婚之日，柱元看见一名插着赤色旗的摆拨兵进城。

在仁祖下定决心要与金自点和赵如贞等人切割，投向公主阵营之际，远方传来李适叛变的消息，姜周愃收到来自明国的密报，金自点得知后便图谋趁此机会在仁祖面前挽回颓势，贞明力劝仁祖不果，仍然决意与领相等人一同留下来死守都城，并在当晚与柱元完成婚礼。

都城终究被李适所率领的反正军攻陷，反正首领李适抓起所有留下来的众臣打算与贞明做交易，怂恿仁祖逃离都城的金自点等人心知若后金真的攻进来，自己的地位亦岌岌可危，纷纷暗自算计着，不忍同伴被杀的贞明终于答应李适的条件，然而柱元等人却另有盘算。

仁佑决意要与柱元有志一同来平定叛军，便临阵夺下张晚将军的指挥权，意图以最少的攻击进入王宫，无奈叛军却已察觉，柱元带领的鸟铳部队便与李适的叛军短兵相接，仁祖一行人收到平定叛乱的消息后回到都城，在自知理亏下却仍一心一意要巩自己的权位。

丁卯胡乱时被抓到后金的朝鲜俘虏之身价，因着两班贵族秘密交易而水涨船高，百姓们只能为自己被掳的家人在宫门前哭诉，甫生下第三胎的贞明听见元孙诞生的消息，便急忙进宫表示祝贺，这时朝廷正流传着贞明与昭显世子暗中来往密切的传闻。

后金派人送勅书来宣称改国号为清，并要求朝鲜与他们结为君臣关系，大为愤怒的仁祖不愿前往城门迎接使臣团，昭显世子为阻止破局而出面，昭显一再向仁祖表明真心，而如贞等人却不断进馋言指世子与贞明勾结，令仁祖在左右为难下终究对昭显世子起了疑心。

仁祖因淑媛的奸计而拒绝与清国结盟，使得朝鲜不得不面临第二次的战乱，昭显世子也因此失去仁祖的信任，面临莫大的危机。当清军已越过国境的消息传来，贞明感到十分不安，不料看守西北方的金自点却露出了一抹微笑，清军势如破竹地直捣都城，令所有人措手不及。

清军势如破竹令朝鲜完全措手不及，仁祖和昭显面临坐困南汉山城的危机，这时，姜周愃带着清国皇帝的口谕前来，姜嫔与贞明等人前往避难的江华沦陷，仁祖在清军要挟下只能向皇太极行三拜九叩头之礼，昭显世子一家与凤林大君被押至沈阳，八年后回归。

昭显世子从清国回归的消息让众百姓欢声雷动，昭容如贞和金自点等人在仁祖病危昏迷之际听见昭显回归的消息，生怕世子会就此继承王位而感到惊慌不已，世子一回归便与贞明公主等人一起筹划对付姜周愃，在仁佑的协助下顺利达成目的，仁祖却在此时醒了过来。

昭显世子向早已被奸佞之言蒙蔽双眼的仁祖哭诉着自己的一片赤诚，无奈却还是被仁祖赶出了大殿，并扬言世子已不再是儿子而是政敌，贞明与柱元看在眼里只觉无限心痛，金自点一干人遭到贞明阵营的反击，便加速了他们谋害昭显世子以断绝对方希望的决心。

昭显之死令仁祖震慑不已，却在金自点和如贞的威胁下不敢将昭显死亡的真相公诸于世，内心充满惧怕的仁祖从此更是撒手政务，任由金自点只手遮天，企图将如贞之子崇善君登上世子之位，贞明为了挽回局面而 联系庄烈王后，庄烈王后便决意带仁祖一同赴温泉疗养。

仁祖及时回宫宣布要册封凤林大君为世子而非崇善君，令金自点等众臣十分讶异，也在朝廷引起了巨大波澜，贞明一派在逮捕金庆征后，为乘胜追击而分别接近金自点与姜周愃，一场尔虞我诈之下，本欲以诬陷贞明谋反的事件演变成金自点与姜周愃狗咬狗的局面。

周愃和金自点为了求自己的活路而背叛了彼此，柱元便向二人宣告他们必然会为设计谋害昭显世子付出代价，金自点并未愤而供出周愃一切罪状，而周愃亦表现得泰然自若，另贞明等人感到事有蹊 跷，知道自己来日无多的仁祖以王的身分做出了最后的抉择。

在朝廷众臣因空白的教旨而惊讶之际，仁祖拖着沉重的身子进入偏殿下达最后的御令，凤林得知仁祖的意图是要将欲对付世子的最后残存势力一并铲除后内心激动不已，贞明更是对仁祖这样的离去 不胜感慨，周愃卯足了最后的力气逃离王宫，并等待着清军的救援。

周愃设法要利用清军使朝鲜陷入窘境逼孝宗退位，而仁佑拖着被刺客所伤的身子四处追查父亲的下落，金自点听见清国问责团已抵达慕华馆的消息便开始采取准备，差人去请求与贞明公主会面，贞 明在与金自点谈完话后，决定孤注一掷把朝鲜的未来交付予金自点。

仁佑代替柱元中枪倒地，柱元惊慌失措地将仁佑移送疗伤，而周愃则因亲手害死了亲儿而失魂跌坐，并被押送至义禁府，在孝宗的严令下，姜周愃、金自点、赵昭容和金瑬等人全部依法受惩，洪 霙和柱元婉拒孝宗的邀请继续留在别造厅，贞明则以华政二字赠予孝宗。