黑崎一护 15岁。是个能看见幽灵的高中生。虽然没什么特殊的能力但总是因心灵现象被卷入纠纷，就这样过着每一天的一护最近感觉到自己的灵力又变得更强了。有一天，一个幽灵女孩遭到一个怪物的攻击而一护也遭到了怪物的攻击。除了一护外没人能看到怪物的样子。一护让女孩赶快逃跑，而怪物则在慢慢逼进。就在这时、出现了个身穿黑衣的少女、拔刀冲向了怪物……

变身为死神的一护将『虚』干掉后的次日早上、一护的家人把昨天晚上发生的事情忘的一干二净了。觉得不可思议的一护上学去了、发现新来的转校生竟然就是昨天晚上的死神——朽木露奇亚。由于大部分的死神能力被一护夺走的关系，为了恢复能力，并强迫一护担任代理死神战斗。但是一护却拒绝了露奇亚。就在这时，一护的同学井上织姫的身边出现了不详的阴影。

『虚』乃是没有被引导入尸魂界的灵魂所堕落而成。堕落为『虚』的灵魂为了埋灭自己的心灵，回去寻找生前最心爱的亲人的魂魄。织姫的哥哥堕落为『虚』后所要的变自己亲生妹妹织姫的魂魄。被强行从容体中撤出灵魂的织姫。和他一起的同学龙贵也被压倒在地。一护来得及救她们么？

一护的同学茶渡带着『被诅咒的鹦鹉』去了学校。一护感觉到鹦鹉灵气并准备给以魂葬。露奇亚对一护这样主动执行死神工作的态度所感动。就在这天傍晚。受了伤的查茶渡被送进了黑崎医院。一护和露奇亚在茶渡所受的伤口伤感觉到了强烈的『虚』的气息。茶渡难道是被『虚』所攻击吗？而在次日早晨，茶渡便从病房里消失踪影。

为了保护『被诅咒的鹦鹉』。露奇亚和『虚』琉理卡展开的厮杀。力量尚未恢复的露奇亚，和看不到『虚』的茶渡于『虚』展开了连协攻势。但是至今已经击退无数死神的琉理卡却早已设下了陷阱。正在这时，一护正在送因感到鹦鹉少女魂魄的凄惨记忆而晕倒的夏梨回家。而露奇亚他们却没感觉到危险已经逼进。

为了补充死神活动必须品而造访浦原商店的露奇亚。店长浦原助是个飘飘然然很不正经的人物。浦原在这个店梨以一些从尸魂界买来的不可思议的物品作买卖。正好露奇亚之前所定购的“义魂丸”这个道具也已经到货了。这是为了能让死神化的一护倒下的一护的身体动起来的道具。

一护和露奇亚在追赶占据了一护身体的改造魂魄。并发现其在一所附近的小学里。一护与强化后的魂魄展开了苦战，最后却让改造魂魄逃跑了。这时露奇亚的传令神机收到了从尸魂界发来的有新的『虚』出现的信息，却由于电池用完找不到『虚』的确切位置。另一方面，改造魂魄担心小学生会被『虚』袭击而返回了学校。

6月17日是一护母亲真咲的忌日。在这天放下手里全部工作的黑崎一家去扫墓了。一护的代理死神工作也休息一天、却发现露奇亚先在墓园里等候了。而露奇亚也询问一护“你母亲是不是被人杀死的”露奇亚怀疑是不是原本以灵力很强的一护为目标的『虚』把真咲给杀死了。而这却触及了一护心中不灭的伤疤。就在这时，为了把在人间界停留时间过长的露奇亚带回去的一个叫西堂的死神出现在了露奇亚面前。

出现在一护面前使用诱饵连续袭击灵力很高的恶贯满盈的『虚』。一护却被那个诱所震惊。那就是6年前母亲死的那个时候出现在一护面前的那个少女的模样。“到底是怎么回事。难不成就是你…”愤怒的一护向着『虚』砍去。但是失去冷静的一护的攻击简单的就被闪开且反被敌人攻击。想要帮助一护的露奇亚却被打飞了。

人气灵媒师唐.观音寺是专门消除恶灵的超人气节目“特急灵场突击之旅”的拍摄组前往空座市。但是对心灵节目极为讨厌的一护不论织姬和哲吾如何诱惑他都不感兴趣。但最后却因为一心和游子想看而一骑陪同了。而来到拍摄现场的一护却看到正要变成『虚』的地缚灵。而观音寺却故意刺激它。

完全已经和一护的同伴们混熟的露奇亚。和不知为了什么而天天从事死神工作的一护。这天也接到了消灭『虚』的命令。但是当他们两人到达现场后却没发现有『虚』的影子。但是却在那里发现了灵魂的口中得知、这就里的确是有『虚』出现过….无奈的一护为灵魂进行了魂葬。就在这时却有个黑影正在盯着他们两个。

憎恨死神的最后的灭却师－石田雨竜，向一护提出了挑战。决斗的内容是『在街上散布诱饵并把『虚幻』吸引出来，然后便看谁杀的『虚』最多』的最糟糕的办法。一护拒绝用这个把办法决斗，但石田却无识一护自己开始了，并聚集了空座镇上一个接一个的『虚』。深知『虚』是以灵力高的人为目标的一护为家人感到担忧。但是，『虚』所针对的目标并不只是夏梨一个而已..

继茶渡和夏梨之后、『虚』把魔抓伸向了织姬和龙贵她们。此时一个利用漂浮的种子操纵人类、并控制被操纵的人去袭击其他人的非常卑鄙的『虚』出现在了学校。被操纵了的学生们围困住的织姬和龙贵虽然好不容易逃了出来，但接着龙贵也遭到了种子的攻击。虽然龙贵为了身体不被操纵而拼命的抵抗，但最终还是被『虚』的直接攻击给打飞了。在那一瞬间，织姬体内沉睡的某种东西苏醒了..

一护和石田分头向着大群拥来的『虚』展开了反击。在战斗中一护对“灭却师”一族灭亡的原因和石田为什么会憎恨死神产生了疑惑。但是石田却为了在死神面前争口气而一个人拼命的战斗。但是却被面前超呼相象的『虚』的数量而吃惊，内心开始焦躁起来。而在此事一护告诉了石田自己战斗的理由。并希望石田能和自己联手一博。而石田却被弄的不知所措。就在这个时候..

被游子当成衣物给洗掉的魂，接着又被整齐地穿上了木偶用的女礼服和花饰。对激怒的魂来说一护根本不是对手。本以为和一护他们度过了这么多次难关的自己已经是一护他们真正的伙伴的魂，结果却被人这样草草对待，伤心的魂从黑崎家飞了出去。并踏上了寻找自己真正栖身之所的旅途。另一方面露奇本以为已经适应现世的身体却感觉到了不协调感..

在露奇亚面前出现的尸魂界的使者。为了和『虚』作战的死神部队护卫13队的6号队队长的朽木白哉和副队长的阿散井恋次。白哉是露奇亚的哥哥，而恋次则是露奇亚的青梅竹马。随着斩魂刀的落下。恋次想从露奇亚的口中逼问出夺走其死神力量的人类的所在地。露奇亚被这2个想都想不到的人物的登场而产生了动摇。就在这时，一护从魂那里得知露奇亚带着一副很冰冷的表情离开了一护的家..

恋次释放出了斩魂刀真正的力量，并向一护袭来。一护在恋次的猛攻之下更本无还手之力。但是露奇亚她知道。一护在越是强大的敌人面前越是不会退却。但是这样下去一护肯定会被杀死！露奇亚飞身缠住了恋次，带着必死的决心挡住那一击，并喊出了“一护！快逃！”就在这时，倒在地上的一护捡起了掉在边上的斩魂刀。只见，一股强大的灵压从一护的体内流淌出来..

在白哉压倒性的攻击下什么都做不了的一护眼睁睁的看着露琪亚被带回了尸魂界.幸得浦原赶到才救了他一命,于是一护决定去尸魂界夺回露琪亚.第二天,到达学校的一护发现班级里同学关于露琪亚的记忆都消失了,他惊呆了.但是,还有人有着对露琪亚的记忆,于是,为了夺回失去的死神的力量,一护到浦原那里展开了特训..

在夺回死神之力的最终试练[绝望的无底洞]。切断因果锁链形成肉体和灵体分离一护要在72小时内夺回死神之力不然就要变成虚。冷汗直流的一护在浦原商店地下特别训练场挖掘的无底洞里接受训练。另外，决定帮助一护去尸魂界救露琪亚的织姬和茶度为了能自由使用自己的力量，接受了夜一的特别训练..

尸魂界：白哉来到露琪亚的牢房告知她将被处刑的决定，在回去的时候遇到了3番队队长市丸银。同时，已经夺回死神之力的一护开始接受浦原对斩魄刀的特训。斩魄刀都有自己的名字，所有者需要呼唤它的名字将其隐藏的神秘力量解放，一护的斩魄刀还没有释放出力量，他必须尽快呼唤出那个沉睡在自己心中的斩魄刀之力。至此，一护他们向尸魂界出发的日子临近了..

穿过[穿界门]的一护，石田，织姬，茶度，夜一来到了现世和尸魂界相连的间隙通道，通道两边有活着的[拘突]，一护他们差点被其吞噬。到达[尸魂界] 的一护他们最先来到的是[流魂街]，这里是被引导来尸魂界的灵魂们最初呆的地方。沿着没什么人影的流魂街，一护他们走向死神们居住的『瀞霊廷』，这是，空中落下巨大的墙壁挡住了去路，同时守护大门的死神出现了。

打开的『白道门』前站立的是护庭13队队长.市丸银。根本不知道有队长存在的一护挥刀向银砍去，完全没有留意夜一惊愕的表情。而银在听到一护的名字后出人意料地解放了斩魄刀向其攻击。一护用斩月辛苦地作着防御。结果，门被关上了。一护他们陷入了困境，此时，躲藏起来的流魂街的居民们出现在一护的面前。

一护他们被一群骑着野猪的男子袭击。领队的名叫岩鹫，他和一护打成一团。忽然响起的闹铃声打断了决斗。野猪军团又像出现时那样离开。留下惊异的一护他们。第二天早上，一行人准备出发去找一个叫『志波空鹤』的人，他可以让他们进入瀞霊廷。但是一护却要在长老家等昨天那个叫岩鹫向和他做个了断。

知道进入瀞霊廷方法的『志波空鹤』原来是流魂街第一烟花师，而前几天骑野猪的岩鹫居然是空鹤的弟弟。不等一护等人还没回过神空鹤讲述了闯入瀞霊廷的方法，那就是一护他们将自己的灵力固定集合成炮弹再用志波家引以为豪的焰火筒从空中打入到瀞霊廷内部。于是一护他们在空鹤的逼迫下开始了灵力炮弹的训练。另一方面，岩鹫对死神的感情极其复杂。

岩鹫的建议使一护能顺利控制灵力使其形成炮弹。目标确立后，夜一向大家大致说了闯入瀞霊廷内的注意事项。为了练习做炮弹一护累的精疲力尽在练习场睡着了，没有休息的的岩鹫则在一边继续拼命练习控制炮弹发射的口诀，在和大家一起闯入瀞霊廷前，岩鹫告诉了他们自己讨厌死神的理由。

灵力炮弹形成，一护他们闯入瀞霊廷。但是一护的灵力控制失败加上撞在瀞霊廷上空覆盖的能切断灵力的遮魂膜上，使得将所有的灵力集中强行闯入的一护他们所处的灵力炮弹在一瞬间爆炸。一护他们被分散落在瀞霊廷各处。石田和织姫、茶度、夜一、一护和岩鹫。总算平安着陆的一护和岩鹫面前却出现了由一角和弓亲组成的死神二人组。

一护他们分为四组落到瀞霊廷，和一护一起的岩鹫在一个转角遇到了十一番队第三席的斑目一角?第五席の绫瀬川弓亲并和他们开始了战斗。和一角的死斗一护完全被其压制，但一护根据一角的动作展开了反击。避开了一角的鬼灯丸的一护释放了必杀的一击。另一方面，岩鹫被解放了斩魄刀的弓亲盯住了。

一护他们在瀞霊廷各处引起了骚动。一护刚打败十一番队第三席の一角又陷入了十一番队的队员们的追击。被十一番队第五席の弓亲盯上的岩鹫死命逃跑以摆脱他的追击，但最后还是被追上了。背后有弓亲，前面有可以切断灵力的『杀気石』围成的巨大洞穴，完全陷入穷途末路的境地。同时，一起行动的织姫和石田身边新的敌人接近了。

决定和四番队的山田花太郎一起行动的一护和岩鹫在其指引下从遍部瀞霊廷各处的下水道向目标——关押露琪亚的忏罪宫前进。“为何告知敌人自己内部的事情？”一护问花太郎。花太郎曾照顾露琪亚并诉说了以往的点滴。另一方面，瀞霊廷进行了副队长们的情报报告会，报告中记录了一护他们打败了大量的死神，所有人一片哗然。

一护和恋次的激战终于开始了。恋次对一护挥舞着斩月，突然解放了蛇尾丸。从最初两人不分胜负，渐渐的一护被恋次压制着.现世中力量受到制约的恋次，灵力提升到初战时的5倍。承受着蛇尾丸的猛攻将死的一护，感觉到攻击一定有弱点存在。接受了若干次攻击的一护，瞄准空隙准备开始反击了……

恋次被觉悟的一护发出的一击震开了老远。在浅浅的意识中，想起了遥远的过去，悔恨涌上心头。和露基亚一起度过的少年时代。在治安混乱的街道，恋次他们像一家人一样生活着.但是没有灵力的朋友们一个一个的死去，露基亚和恋次为了从这样的生活中摆脱出来，决意成为死神。随后进入了死神的学校[震央灵术院]，分开两人命运的日子到来了。

一护启程到尸魂界这几天，没有人在那些区域当死神了。奇妙事件不断发生。那天，一护的妹妹游子和夏梨与不知何故从天而降的酷似一护的小猫遇到。因为颜色和驼绒毛相近，被游子取名为小驼而疼爱着。不断有虚涌来袭击小驼。另一方面浦原商店的两个小孩也来帮忙...

和恋次做了了断的一护，就那样失去意识倒下了。在其他死神赶来前，花太郎和岩鹫带着一护藏身于下水道。花太郎使用只有四番队具有的治愈力量为濒死的一护治疗；另一方面，六番队副队长恋次的败北给队长们带来了冲击。护庭十三队总队长山本元柳向一护一行发出全面战争的宣言。径庭内传遍战时特令…

被发现的蓝染的样子惨不忍睹，使得副队长雏森桃震惊。此时，带着深邃笑容的三番队队长市丸银出现。十番队队长日番谷曾警告过雏森要小心三番队队长，她一见到市丸后就发狂，向市丸发起攻击。三番队副队长吉良挡住了攻击。雏森和吉良，两个同是副队长，都解放了斩魄刀，进入对峙的异常事态。就在两人的斩魄刀交锋之时…

暴走后的雏森被十番队队长日番谷关到了五番队的牢中，在牢中，出现了带来已死的蓝染给雏森的信的十番队副队长松本乱菊。在信件中，写着蓝染所查明的有关尸魂界的所有恐怖阴谋。另一方面，一护一行遇上十一番队队长更木剑八，并被起惊人的灵压所压制。一护为了让岩鹫和花太郎逃走，单枪匹马迎战更木剑八…

进入瀞灵廷后落单的茶渡向忏罪宫赶去，强悍的茶渡一路上没有遇到敌手，就连八番队的三席也被他一击打到。但这次挡在茶渡面前的是八番队队长京乐春水，他的实力和茶渡之前遇到的敌人完全不同，茶渡使出全力的攻击竟然全部落空，而京乐却并没有与茶渡战斗的意思一直劝他放弃，在得知茶渡挥拳的理由与决心后，京乐终于认真了起来。

从里廷队传达来了一级戒严令，京乐春水得知蓝染的死讯。一护与剑八的战斗仍在继续，一护使出决心的斩击竟然伤不了剑八分毫，不知所措的一护到处逃窜寻找战斗的方法，在感觉到茶渡灵压突然变得很微弱后，意识到如果自己被打败那些赶来帮助自己的朋友们也会陷入危机，认识到这点的一护有了觉悟重新站在了剑八的面前。

握着被折断的斩月，身受重伤的一护仍然想要胜利，斩月大叔感受到一护的意志后把他带入内在世界，为了通过大叔的考验，一护与白色的自己争夺斩月，在这过程中了解到了斩魄刀并不是战斗的道具，而是并肩作战的伙伴，明白了这些后斩月大叔决定再给他一次机会。重新站起来的一护虽然占着优势，但不管怎么攻击剑八都不会倒下。

一护与剑八在激战过后双双倒下，剑八回想起在流魂街与八千流相遇的情景，并希望自己变得更强。岩鹫与花太郎终于成功潜入忏罪宫，但令岩鹫万万没有想到的是，自己拼上性命想要救出的露琪亚竟然就是杀死哥哥的死神。而这时，朽木白哉出现在了门外，被花太郎打动的岩鹫决定把哥哥的仇暂时放在一边，挺身挡在了白哉面前。

被夜一所救的一护渐渐苏醒，得知茶渡虽然受了伤但并没有死，而织姬与石田也没有被发现，听到同伴们都没有事后悬着的心终于放了下来。在一护正为夜一的真面目所吃惊时，突然感受到忏罪宫白哉强大的灵压，想到岩鹫和花太郎的安危一护不顾自己的伤冲了出去。十三番队队长浮竹赶到制止白哉后，一护出现在忏罪宫上空，来到露琪亚的身边。

就在白哉将要解放斩魄刀千本樱时，夜一及时赶到，失踪了一百年多年的四枫院夜一使在场的众人惊讶不已。深知没有胜算的夜一打晕一护后强行将其带走，白哉随即上前阻挡，一场速度的较量便开始了，几个回合后拥有“瞬神”称号的夜一还是带着一护逃了出来，并约定休战三天。另一方面，石田和织姬伪装成死神继续朝忏罪宫前进。

相处的这段时间里，石田深刻的了解到不希望任何人受伤的织姬并不适合战斗，就在两人赶往忏罪宫的途中遭遇了十二番队队长兼技术开发局长涅茧利的袭击，涅茧利得知织姬会使用特殊的能力后想要将其当成实验对象，石田为了让织姬逃走独自应战，涅茧利作战的手法相当卑劣，竟把部下和副官都当做是战斗的道具，被疋杀地藏刺中不能动弹的石田陷入危机。

得知涅茧利便是害死自己祖父并将其作为实验材料的元凶，愤怒的石田堵上灭却师的尊严要杀死他，虽然使用乱装天傀这种高超的战斗灵术，但还是处于劣势。祖父留给石田的散灵手套，是可以接近灭却师巅峰的道具，一旦戴上便不能脱下，脱下后虽然会瞬间得到极大的力量，但之后却会失去作为灭却师的所有力量，面对眼前这个不得不打到的敌人，石田毅然卸下了手套。

一护在夜一的指导下学习卍解，想要学会卍解需要的是斩魄刀的具象化与屈服，一护必须在三天内使被转神体具象化的斩月大叔屈服，而唯一的方法便是从众多的刀中找出真正的斩月击败大叔，即便再优秀的人至少也要花上十年的修炼，一护真的有办法在三天内学会吗？另一方面，茶渡、石田和岩鹫虽然被打败但也接受了治疗。

拘禁牢内雏森想起在真央灵术院学习的时候，作为一届生的雏森、吉良和恋次在特别提高一班里，为了成为优秀的死神而每日努力的修炼。在一次队长巡视学院时，雏森深深被蓝染队长的强大和温柔打动，暗暗的决定成为死神后要进入蓝染队长的五番队。而在现世进行与模拟虚对战的训练时，蓝染又救了被巨型虚围困的他们。

雏森、恋次和吉良为了不同的目的都从牢内逃了出来，得知此事的日番谷预感雏森会去找市丸银报仇，为了避免雏森受到伤害日番谷先行去找市丸银，决定在雏森之前打到他。而这时雏森赶到，令人意想不到的是，两眼含泪的雏森把刀指向日番谷，蓝染的信中提到的幕后黑手竟写着日番谷冬狮郎，一边是尊敬的队长一边是青梅竹马，无法进行判断的雏森把刀挥向日番谷。

日番谷认定篡改蓝染信件，并逼雏森与他刀剑相向的正是市丸银，看着倒在地上的雏森，愤怒的日番谷拔出斩魄刀攻向市丸银。两个队长级别的人展开了凌厉的攻势，日番谷使用的冰轮丸是冰雪系最强的斩破刀，攻击十分迅猛，连在一旁吉良也被波及，而被困住的市丸银也毫不示弱，日番谷躲过市丸银的神枪后，刀尖直指雏森。

露琪亚处刑时间一再被缩短，明天要被处刑的露琪亚回想着永远无法忘记的事情。刚到十三番队的露琪亚，因为出身名门而无法和其他队员正常相处，身为副队长的志波海燕却能平凡的对待她，那时的露琪亚被这个平和随意的副队长深深打动，并憧憬这他美丽的妻子都。而身为三席的都带着部下执行侦察任务时发生了意外，这个意外引发了露琪亚一生的恶梦。

为了挽回人气，观音寺想使空座heroes更加活跃，首先当然是召集组员，遭到夏梨拒绝后遇到了从游子身边逃出来的魂，在观音寺的劝诱下魂以空座king的名字加入队伍。游子、甚太和小雨也再次加入队伍，他们一起对魂展开了魔鬼式训练，半途逃走的魂被虚抓住，众人赶来营救魂时遭到了虚的攻击，就在游子陷入危机时，夏梨及时赶到。