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1鲸鲨
海底小纵队遭遇鲸鲨,巴克和呱唧外出寻找达西西时被鲸鲨吸入腹中,他们在鲸鲨肚子里相逢,在皮医生的帮助下,他们从鲸鲨肚子里逃了出来。
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2海底风暴
海底一场风暴来袭,队长巴克要求大家在风暴来临之前做好准备。队长给每个人分配好迎接风暴的任务。
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3螃蟹海胆
深夜,一阵阵敲门声惊动章鱼堡。原来是海蜗牛前来求救,呱唧决定去探险。在呱唧和巴克队长的劝说下,螃蟹和海胆分开了。海蜗牛们终于可以睡觉了。
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4海象首领
海象无意中找到一个医药包,皮医生向队长求救,海底小纵队成员伪装成海象开始问海象家族拿回医药包。
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5小飞鱼
海底小纵队追捕正在逃跑中的小飞鱼,不幸的是其中一条小飞鱼不能飞起来。巴克队长要求小飞鱼一起回章鱼堡。皮医生拯救了小飞鱼。
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6大王乌贼
海底小纵队的成员们在厨房忙碌着,巴克发现了海底洞穴,求教章教授,章教授说大王乌贼是它的表哥。
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7大虎鲸
章鱼堡被大虎鲸包围,且遭到撞击。原来是因为大虎鲸好奇章鱼堡发出的声音。海底小纵队和新朋友大虎鲸玩起了游戏。
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8逃离海藻行动
海底小纵队发现海底一个废弃的地方,这里布满了海藻,海底小纵队的潜艇不幸被海藻缠住,大家开始了逃离海藻行动。
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9浆足动物
谢灵通想要寻找桨足动物,可是巴克队长担心谢灵通不会驾驶魔鬼鱼艇。独自去寻找桨足动物的谢灵通,不小心撞船了,巴克队长带领小纵队前去搭救。