1如今在古老边狱之底
Mooncell的灵子虚构世界“SE . RA . PH”。在这个世界，过着无聊生活的学生岸浪白野，日常的风景莫名其妙的“憎恨”了起来。学园突然崩溃，剩余生命体的清洗开始了。本应是朋友的慎二却背叛了自己，受伤的白野顽强地挣扎求生，掉到了被称为“边狱”的焚烧炉底。在那里，白野看到的是一柄赤煌的大剑。 死相―デッドフェイス─脚本：奈须きのこ・桜井 光分镜：黒沢 守演出：南川达马作画监督：大梶博之・佐藤浩一・浜 友里恵・保村 成・马场一树“边狱”，白野被自称“Saber”的少女救了姓名。记忆暧昧，连自己谁不知道，只晓得“憎恨”变强的白野，但从Saber口中得知SE . RA . PH举行圣杯战争的参加者是以炽天之栏为目标，第一战的会场到达了，就是白野和Saber眼前的广阔美丽的海洋都市。两人为了寻找对战对手，围绕着海洋城市开始行动——
2死相 Dead Face
“边狱”，白野被自称“Saber”的少女救了姓名。记忆暧昧，连自己谁不知道，只晓得“憎恨”变强的白野，但从Saber口中得知SE . RA . PH举行圣杯战争的参加者是以炽天之栏为目标，第一战的会场到达了，就是白野和Saber眼前的广阔美丽的海洋都市。两人为了寻找对战对手，围绕着海洋城市开始行动——
3黄金鹿与暴风夜
白野和Saber到达了，第一层·新设海洋都市Cape。在那里，御主为了保障生活，将英灵卖给政府。白野和Saber遭到了白野学园时代的朋友的慎二的英灵们袭击，在原御主·远坂凛的帮助下，英灵找不到白野等人的踪迹。凛是为了登上上层需要打倒慎二，了解情况之后，白野决定再次与慎二对抗。
4无貌之王 No Face May King
第一层阶层主的慎二和德雷克被白野和Saber打败了。为什么要以上层作为目标呢，德雷克向白野问道。在到达第二阶层的同时，被什么人袭击，俯视着逃进森林的两人。Saber为了救白野而受伤，从而陷入了困境。这时，一个少女出现在两人的面前——
5祈祷之弓 -Yew Bow-
白野和Saber在遭到丹和罗宾汉的袭击，暂避于拉尼Ⅷ的藏身之所。了解到现在3020年，SE·RA·PH崩溃的话，人类灭亡的情况。三人进行再战的作战会议。拉尼Ⅷ表示，丹是胜利也无法登上上层的，罗宾汉有两种的宝具，但无法同时使用。白野等人再次向丹和罗宾汉发起挑战朝森林行进。
6永久机关·少女帝国 -Queen's Glass Game-
丹和罗宾汉被白野夺胜后。第二阶层因为失去了阶层主而要消亡的时候，拉尼Ⅷ决定留下与该阶层共存亡。白野和Saber前往下一个阶层。第三阶层是亡灵和梦想的废土，通称无名之森。凛表示，这是Code中的BUG。电子幽灵游荡于森林和荒城中，在城中搜索的白野看到了人影而追了上去。
7为某人所写的故事-Nursery Rhyme-
感到奇怪的白野等人继续在无名之森探索的时候，突然出现了“怎么也无法杀死的怪物”，Saber将其斩杀，众人却重新回到了起点。凛表示，怪物的本体是“爱丽丝”用了“这一日”，按照自己所想返回到原状。为了突破现状而再次展开探索的白野也袒露了心声，向众人说明自己的憎恨。
8无二打 -Dead End-
经过第三阶层的战斗，怀着希望以上层为目标的白宫，到达了“沙沙作响的街道”第五阶层。虽然在远处可以看到延续到上层的拉达，但是在这个阶层中徘徊着被称为杀人鬼的尤里乌斯，据说，在到达拉达之前如果遇到了就不得不战斗了。然后在路上，白宫他们遇到了尤里乌斯和伯瑟克。由于从Berserker的攻击保护了Hakuno的事，Saber负大的伤被强迫苦战。
9邀至心荡神驰的黄金剧场 -Aestus Domus Aurea-
尤里乌斯和李书文的战斗败北，倒下的白宫和Saber。晕倒了的Hakuno，在象试映室一样的地方遇到作为Saber的原主人的岸波白野。在那里，能显出关于白野和nero的过去的话，并且saber"nero·kuraudius"的生涯的映像。恢复意识的Hakuno，对Saber毫不隐瞒地说出了自己的真实身份，坦白自己没有作为主人的资格。
10无限的残骸-Unlimited Raise Dead-
尼禄开展了宝具《招荡的黄金剧场》，击败了李书文。白宫也发现了死神的面具，并在与尤里斯的战斗中获胜。留下Lin和Lani，Hackno和Nero朝着下一个阶层进入了Rader。到达第六层后，就会出现大量和琳酷似从者和巨大的拉尼。这个二人组不知为何好像在对付敌人。在感到困惑的尼禄和河野面前，一起战斗到第五层的林出现了。