18月31日
暑假即将结束的这天，又是和美琴扮演假情侣约会，又是与阿兹特克的魔法师交战，上条的日常生活依然热闹又忙碌，堆积如山的暑假作业当然完全没有写。在学生宿舍里，茵蒂克丝在欣赏《超机动少女加奈美》，斯芬克懒散打发时间，只有上条在毫无希望的困境独自奋战。在上条拼命赶作业的时候，学园都市附近的海岸，有一群人爬上消波块登陆了。全身穿着金属铠甲的他们――英国清教的骑士身后，忽然响起拔刀声，众人回头一看，“圣人”神裂火织手持七天七刀，挡住他们的去路。
2法之书
以暗号写成的魔道书《法之书》，以及能解读这本书的修女，都被天草式十字凄教抓走了。由于无法连络上天草式前任女教皇神裂，英国清教担心将会与拥有魔道书罗马正教起冲突，因此派遣史提尔前往学园都市，希望在事件闹大之前解决。另一方面，学园都市忙于举办秋季各种祭典，各校致力于准备第一项活动――完全不限制使用能力的校际对抗运动会“大霸星祭”。在这个时候，上条收到茵蒂克丝被抓的消息，并且依照犯人要求，独自前往学园都市外部的废弃剧场，却在途中的公车站遇见一位修女。
3天草式
天草式十字凄教，再度在上条等人的面前抓走奥索拉。上条与史提尔、罗马正教的雅妮丝，前往天草式藏身的平行甜点乐园搭救奥索拉。必须在对方使用特殊移动法“缩图巡礼”逃走之前压制对方并带回奥索拉。雅妮丝的主力部队负责声东击西，上条与史提尔则是负责救出奥索拉。在天草式成员手持武器袭击的场面里，上条再度被史提尔当成诱饵，好不容易逃离战场并藏身的上条，遇见被胶带捆绑的奥索拉并将她解救，然而在这个时候，史提尔伤痕累累倒在他们的面前。
4魔灭之声
上条等人成功营救了奥索拉，然而天草式十字凄教的代理教皇建宫表示，不可以将她交给罗马正教，会解读《法之书》的奥索拉会遭到灭口。上条受到罗马正教修女们攻击，因而相信建宫的说法，但史提尔表示这是罗马正教内部的事情，外人不能介入。看到建宫独自前往拯救奥索拉和同伴，上条深刻体会到自己的无力，在自我检讨之后，上条实在无法放弃，因而独自前往“奥索拉教会”，并且在雅妮丝带领的众多修女面前，宣布要救出奥索拉。在这个时候，建宫、天草式成员与茵蒂克丝全部现身，为了救出奥索拉而并肩奋战。
5莲之杖
罗马正教的修女们破解茵蒂克丝的“魔灭之声”，再度转守为攻。人数上屈居劣势的上条等人，好不容易逃进一间教堂，希望解读“法之书”扭转局势，却发现奥索拉的解读方式是假的。后来上条想出某个作战，独自前去寻找雅妮丝。雅妮丝挥动司教之杖，表示如果想打倒自己这名司令官反败为胜，是一种大错特错的想法。雅妮丝每次伤害手杖，某处就会出现冲击波攻击，使得上条无计可施被打倒在地。雅妮丝宣称只有罗马正教才是十字教的唯一教义。
6残骸
大霸星祭将近，学园都市逐渐变得忙力，常盤台中学的全校体育课结束之後，黑子和美琴一起前往内衣专卖店，却因为初春通知有强盗事件发生，逼不得已赶回风纪委员分布。依照监视器影像，一群人在争夺一个行李箱，而且箱子有第23学区的标志，确认是能隔离宇宙射线的特殊箱子。黑子前去接触这些看似学园都市外部的人们，并且轻易制服他们夺回箱子，却忽然遭受到神秘少女的袭击，使得箱子再度被抢走。拥有“瞬间移动”系能力“坐标移动”的这名少女，不知为何知道黑子的姓名与所属单位，甚至还说出美琴的名字。
7坐标移动
黑子目睹美琴与“坐标移动”的结标交战，并且听到美琴所说的话。为了守护美琴的世界，黑子决定寻找逃亡的结标与其交战。“空间移动”能力者之间的战斗是在瞬间定局，黑子错失先机而受制，结标则是藉机述说自己的计画。她要和外部组织“科学结社”联手，将“树状图设计者”复原，而且也邀请同为高等能力者的黑子加入。然而黑子绝对无法容忍那个践踏美琴内心的计划重新启动，因此断然拒绝并尝试进行最后抵抗。另一方面，掌握结标等人动向的“妹妹们”，也为了阻止计划展开行动，两名少年就这样回应她们的请求挺身而出。
8大霸星祭
学园都市所有学校共襄盛举的大规模运动会“大霸星祭”。这是学园都市少数对外开放的活动，还没开幕就已经盛况非凡，一如往常被美琴缠上的上条，答应了“输了就愿意听对方的任何命令”这个条件，以大霸星祭的各校总成绩一决胜负。然而上条前去参加第一项竞赛“推杆”的时候，却看到同学们毫无干劲的模样，使得他和美琴的赌注早早就出现危机，然而在这个时候，小萌老师却在体育馆后面，被对方学校的老师瞧不起了。看到老师脆弱的身影，上条等人团结一致，夹带着杀气冲向对方的阵地。另一方面，在快乐热闹的气氛背后，罗马正教雇用的“送货人”悄悄潜入了学园都市。
9追踪封锁
能够将圣人一击毙命的灵装“刺突杭剑”被带进学园都市。上条从土御门他们那里得知这个消息之后，协助他们在大霸星祭寻找灵装。上条巧遇本次的当事人，也就是“送货人”欧莉安娜·汤森，与土御门和史提尔会合之后继续跟踪，却中了她设下的陷阱。虽然上条以右手解除危机，却使得欧莉安娜趁机逃离。土御门在史提尔的协助之下，使用魔法寻找欧莉安娜的所在处，但连这个魔法都被欧莉安娜看穿，史提尔因而中了陷阱受伤。土御门为了解除欧莉安娜的陷阱而使用另一项魔法，然而在找到陷阱位置之前，史提尔必须备受折磨，是一种极为残酷的方法。
10速记原典
即使好不容易解除陷阱，欧莉安娜的魔法却害得吹寄昏倒。欧莉安娜把无辜平民卷入的这种做法，令上条大为光火。在史提尔的协助之下，上条和土御门追上欧莉安娜，却在最后关头被她搭乘无人公车逃走。即使史提尔灵机一动炸掉公车，欧莉安娜依然轻易走出火场，使用能瞬间写出魔道书原典的“速记原典”应战。在战斗中，曾经受伤的土御门陷入瘫痪状态，千变万化的魔法也令上条吃尽苦头。后来上条以右手使出舍身一击逆转战局，欧莉安娜逼不得已放下“刺突杭剑”逃亡。原本以为只要上条以右手破坏“刺突杭剑”，这个事件就算是结束了，但是事实却不是这样。
